RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 F8W735 103 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP5.66□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 HPRT1P00492 218 aa5.66□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 HLA-DQB1P01920 261 aa5.66□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 DTYMKP23919 212 aa5.66□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 MFAP4P55083 255 aa5.66□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 OR1L8Q8NGR8 309 aa5.66□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 SCARB1Q8WTV0 552 aa5.66□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 C5orf30Q96GV9 206 aa5.66□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 OR10C1Q96KK4 312 aa5.66□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 FKBP11Q9NYL4 201 aa5.66□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 TAS2R8Q9NYW2 309 aa5.66□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 X6R8D5 127 aa5.66□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A075B6Q4 140 aa5.65□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 UPK2O00526 184 aa5.65□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 GNG7O60262 68 aa5.65□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 WBP4O75554 376 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 SNAPC5O75971 98 aa5.65□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 RPL30P62888 115 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 TNP2Q05952 138 aa5.65□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAM1Q15629 374 aa5.65□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 MSMO1Q15800 293 aa5.65□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 PLAC9Q5JTB6 97 aa5.65□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 UBE2UQ5VVX9 321 aa5.65□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM90A2PQ658T7 463 aa5.65□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF773Q6PK81 442 aa5.65□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF767PQ75MW2 155 aa5.65□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 TPRA1Q86W33 373 aa5.65□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 SPAG16Q8N0X2 631 aa5.65□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 OR10R2Q8NGX6 335 aa5.65□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 PYDC1Q8WXC3 89 aa5.65□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 FRZBQ92765 325 aa5.65□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM3DQ96BQ1 224 aa5.65□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 MND1Q9BWT6 205 aa5.65□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 HINT2Q9BX68 163 aa5.65□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 DCSTAMPQ9H295 470 aa5.65□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNK15Q9H427 330 aa5.65□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 SCGNO76038 276 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 CTSGP08311 255 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 UCHL1P09936 223 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 CD37P11049 281 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 NPPCP23582 126 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 GNRHRP30968 328 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 NPBWR1P48145 328 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 POU2AF1Q16633 256 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 C2orf76Q3KRA6 126 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 ACTL10Q5JWF8 245 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 CNIH2Q6PI25 160 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 GSG1LQ6UXU4 331 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 SPATA12Q7Z6I5 190 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 CADM3Q8N126 398 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF485Q8NCK3 441 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 STXBP6Q8NFX7 210 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 TSPAN14Q8NG11 270 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 MAFIPQ8WZ33 124 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 UFD1Q92890 307 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 MOB3AQ96BX8 217 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 NEU1Q99519 415 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 TSC22D3Q99576 134 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM140Q9NV12 185 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 COMMD9Q9P000 198 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 CELA1Q9UNI1 258 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 V9GY05 133 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 HSPG2P98160 4391 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa5.63□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa5.63□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa5.63□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa5.63□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 HELTA6NFD8 242 aa5.63□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 MFNGO00587 321 aa5.63□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 PDCD5O14737 125 aa5.63□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 HTN3P15516 51 aa5.63□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB6AP20340 208 aa5.63□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 EMP1P54849 157 aa5.63□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 CCL18P55774 89 aa5.63□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 OXA1LQ15070 435 aa5.63□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 TTC32Q5I0X7 151 aa5.63□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF600Q6ZNG1 722 aa5.63□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 NANOGP1Q8N7R0 232 aa5.63□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 OR1P1Q8NH06 330 aa5.63□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 ST8SIA2Q92186 375 aa5.63□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC25A46Q96AG3 418 aa5.63□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF414Q96IQ9 312 aa5.63□□□□□ -1.51
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