RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263012.10

NOMO3-201, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOMO3, Length 3,911 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-201ENST00000263012 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 C2CD3Q4AC94 2353 aa14.87□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 TMEM250H0YL14 139 aa14.87□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 LYL1P12980 280 aa14.87□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa14.87□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 WIPI2Q9Y4P8 454 aa14.87□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 OR51B2Q9Y5P1 312 aa14.87□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 WNK1Q9H4A3 2382 aa14.87□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa14.87□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa14.86□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 MMDQ15546 238 aa14.86□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 SLC25A53Q5H9E4 307 aa14.86□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 C10orf91Q5T1B1 145 aa14.86□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa14.86□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 ITLN1Q8WWA0 313 aa14.86□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 NEU1Q99519 415 aa14.86□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 PLSCR2Q9NRY7 297 aa14.86□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 DENND4AQ7Z401 1863 aa14.86□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa14.86□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 DNPH1O43598 174 aa14.86□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 OR5AL1P0C617 328 aa14.86□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 LINC00869P0C866 280 aa14.86□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 CTSSP25774 331 aa14.86□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 NHLH1Q02575 133 aa14.86□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 GABRA6Q16445 453 aa14.86□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 MIR17HGQ75NE6 70 aa14.86□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 LRTM2Q8N967 370 aa14.86□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 METRNQ9UJH8 293 aa14.86□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 GZMHP20718 246 aa14.86□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 CD82P27701 267 aa14.86□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 IL15RAQ13261 267 aa14.86□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 TNXAQ16473 311 aa14.86□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 PMS2CLQ68D20 193 aa14.86□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 DEFB123Q8N688 67 aa14.86□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 IL19Q9UHD0 177 aa14.86□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 S4R3C0 116 aa14.86□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 SRP14P37108 136 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP14.86□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 NKX6-3A6NJ46 265 aa14.85□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 GCHFRP30047 84 aa14.85□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 LCN12Q6JVE5 192 aa14.85□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa14.85□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 OR8A1Q8NGG7 326 aa14.85□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 CA2P00918 260 aa14.85□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 IGKV1D-33P01593 117 aa14.85□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 IGKV1-33P01594 117 aa14.85□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 COL8A1P27658 744 aa14.85□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 TRAV3A0A0B4J244 114 aa14.84□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 J3KRW8 73 aa14.84□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 OR2J3O76001 311 aa14.84□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 RAB7AP51149 207 aa14.84□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 VWA1Q6PCB0 445 aa14.84□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 GGNQ86UU5 652 aa14.84□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 GNB4Q9HAV0 340 aa14.84□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 CEACAM18A8MTB9 384 aa14.84□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 CT45A10P0DMU9 189 aa14.84□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 PAX9P55771 341 aa14.84□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 BPIFB3P59826 476 aa14.84□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 ZNF726P1Q15940 193 aa14.84□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 C1orf210Q8IVY1 113 aa14.84□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 NABP2Q9BQ15 211 aa14.84□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP14.84□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 PMCHL1Q16048 86 aa14.84□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 TEX38Q6PEX7 206 aa14.84□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 PGLYRP4Q96LB8 373 aa14.84□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 MED12LQ86YW9 2145 aa14.83□□□□□ -0.03
NOMO3-201ENST00000263012 MOSP00540 346 aa14.83□□□□□ -0.04
NOMO3-201ENST00000263012 FA2HQ7L5A8 372 aa14.83□□□□□ -0.04
NOMO3-201ENST00000263012 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
NOMO3-201ENST00000263012 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
NOMO3-201ENST00000263012 PTPN13Q12923 2485 aa14.83□□□□□ -0.04
NOMO3-201ENST00000263012 CACNA1AO00555 2505 aa14.83□□□□□ -0.04
NOMO3-201ENST00000263012 MLANAQ16655 118 aa14.83□□□□□ -0.04
NOMO3-201ENST00000263012 PDPNQ86YL7 162 aa14.83□□□□□ -0.04
NOMO3-201ENST00000263012 OR9G9P0C7N8 305 aa14.83□□□□□ -0.04
NOMO3-201ENST00000263012 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
NOMO3-201ENST00000263012 OR8B2Q96RD0 313 aa14.83□□□□□ -0.04
NOMO3-201ENST00000263012 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
NOMO3-201ENST00000263012 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa14.82□□□□□ -0.04
NOMO3-201ENST00000263012 RPL11P62913 178 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
NOMO3-201ENST00000263012 TMEM170AQ8WVE7 144 aa14.82□□□□□ -0.04
NOMO3-201ENST00000263012 RAB37Q96AX2 223 aa14.82□□□□□ -0.04
NOMO3-201ENST00000263012 TMEM167BQ9NRX6 74 aa14.82□□□□□ -0.04
NOMO3-201ENST00000263012 FREM2Q5SZK8 3169 aa14.82□□□□□ -0.04
NOMO3-201ENST00000263012 PGPA6NDG6 321 aa14.82□□□□□ -0.04
NOMO3-201ENST00000263012 FAM90A10PA6NDY2 464 aa14.82□□□□□ -0.04
NOMO3-201ENST00000263012 FAM90A18PA6NE21 464 aa14.82□□□□□ -0.04
NOMO3-201ENST00000263012 FAM90A16PA6NEW6 464 aa14.82□□□□□ -0.04
NOMO3-201ENST00000263012 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.7 ms