RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 Q8N3U1 123 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 OR10P1Q8NGE3 313 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 OR10X1Q8NGY0 326 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 LYPD6BQ8NI32 183 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 SFT2D1Q8WV19 159 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 ADTRPQ96IZ2 230 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 HINT2Q9BX68 163 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC35D1Q9NTN3 355 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 KAAG1Q9UBP8 84 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 ACACBO00763 2458 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 TANC2Q9HCD6 1990 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 IFNA10P01566 189 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 IGKV1-16P04430 117 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 CD5P06127 495 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 SOD3P08294 240 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 MYOD1P15172 320 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 DLX1P56177 255 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 SPCS3P61009 180 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 CCL20P78556 96 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM30BQ3MIR4 351 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 SMUG1Q53HV7 270 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 OR4A47Q6IF82 309 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 ABHD12Q8N2K0 398 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 OR10A7Q8NGE5 316 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 RAB39BQ96DA2 213 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 CLCC1Q96S66 551 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM204Q9BSN7 226 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 RAB1BQ9H0U4 201 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 VSIRQ9H7M9 311 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 HCFC1P51610 2035 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 CACNA1BQ00975 2339 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 AKAP6Q13023 2319 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 PPIHO43447 177 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 HRASP01112 189 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 OPN1MWP04001 364 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 SFTA3P0C7M3 94 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 OPN1MW2P0DN77 364 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 OPN1MW3P0DN78 364 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 ELLP55199 621 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 RTL8BQ17RB0 113 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 OR13D1Q8NGV5 346 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 HIPK2Q9H2X6 1198 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 RPRMQ9NS64 109 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 CBLN4Q9NTU7 201 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 TCF19Q9Y242 345 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 PMS2P5A8MQ11 134 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 J3QR06 171 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 TSPAN4O14817 238 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 IGLV1-40P01703 118 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 PPOXP50336 477 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 TLE4Q04727 773 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 PEA15Q15121 130 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 ATP6V1FQ16864 119 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM155Q4W5P6 130 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 AKIRIN2Q53H80 203 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 SPSB3Q6PJ21 355 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 ETV3LQ6ZN32 361 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 SVBPQ8N300 66 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 COMMD1Q8N668 190 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 RARRES2Q99969 163 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM147Q9BVK8 224 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 SEC11CQ9BY50 192 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A1W2PPR1 153 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 SMCO3A2RU48 225 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 C15orf61A6NNL5 157 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 C15orf62A8K5M9 175 aa3.24□□□□□ -1.89
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LRRTM4-201ENST00000409088 APOA2P02652 100 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 IFNA4P05014 189 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 OR8U8P0C7N1 319 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 IGHV1-8P0DP01 117 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 FGF7P21781 194 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 PLA2G5P39877 138 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 HAGHQ16775 308 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 LCN15Q6UWW0 184 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF841Q6ZN19 808 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 PBDC1Q9BVG4 233 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 ENY2Q9NPA8 101 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 TNCP24821 2201 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 MED13LQ71F56 2210 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 DCHS2Q6V1P9 2916 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa3.24□□□□□ -1.89
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