RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 RHOVQ96L33 236 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 SIRT7Q9NRC8 400 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC35D1Q9NTN3 355 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM140Q9NV12 185 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 WSB1Q9Y6I7 421 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 IAPPP10997 89 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 COX7A1P24310 79 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 PDLIM4P50479 330 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 OR2B8PP59922 312 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 RELBQ01201 579 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 BEND2Q8NDZ0 799 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 SCARB1Q8WTV0 552 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 RAB40CQ96S21 281 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 RBKSQ9H477 322 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 MMP26Q9NRE1 261 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 M0R1W7 72 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 TAAR5O14804 337 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 SPP1P10451 314 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 VAMP2P63027 116 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 LCN2P80188 198 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 POU2AF1Q16633 256 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 OR4A47Q6IF82 309 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 PDZD9Q8IXQ8 264 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 PNKDQ8N490 385 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 OR13D1Q8NGV5 346 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 ZDHHC16Q969W1 377 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM231Q9H6L2 316 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 ABCA12Q86UK0 2595 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 A8MXK9 166 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 CST7O76096 145 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 PLA2G2AP14555 144 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 RAB13P51153 203 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 ATP5J2P56134 94 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 BAP18Q8IXM2 172 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 C10orf105Q8TEF2 133 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1W2PPE2 198 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1W2PR64 198 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1W2PRV1 198 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 VWC2LB2RUY7 222 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 LY6LH3BQJ8 138 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 PRRX1P54821 245 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 RTL8BQ17RB0 113 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM168AQ92567 244 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 SMIM8Q96KF7 97 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 CSMD1Q96PZ7 3565 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 TPT1P13693 172 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 PRTN3P24158 256 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 AKR1C3P42330 323 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 KRTAP10-9P60411 292 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 ERVK-16P61578 105 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 KLRD1Q13241 179 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 SPINK9Q5DT21 86 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 BPIFCQ8NFQ6 507 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 OR11H6Q8NGC7 330 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 PHYHIPLQ96FC7 376 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 PERPQ96FX8 193 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 RITA1Q96K30 269 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 BIN3Q9NQY0 253 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 PSENENQ9NZ42 101 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM157AC9JC47 383 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 HRASP01112 189 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 TAS2R30P59541 319 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 ARL16Q0P5N6 197 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 GUCA2BQ16661 112 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM177Q53S58 311 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 HAPLN4Q86UW8 402 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM217Q8N7C4 229 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 PCGF1Q9BSM1 259 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC25A31Q9H0C2 315 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 SIRPDQ9H106 197 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 APCP25054 2843 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 ENSAO43768 121 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 PAX1P15863 534 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF429Q86V71 674 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 KIR3DL3Q8N743 410 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 UBAC2Q8NBM4 344 aa7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.4 ms