RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 NXPH3O95157 252 aa18.47■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 UBE2KP61086 200 aa18.47■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 RELBQ01201 579 aa18.47■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP18.47■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 BAXQ07812 192 aa18.47■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 RHOVQ96L33 236 aa18.47■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 SIRPDQ9H106 197 aa18.47■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 RBKSQ9H477 322 aa18.47■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 FBXL17Q9UF56 701 aa18.47■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 ODF3BA8MYP8 253 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 LY86O95711 162 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 COX7A1P24310 79 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF429Q86V71 674 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 SCARB1Q8WTV0 552 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 LHX4Q969G2 390 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 WASHC3Q9Y3C0 194 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 SPDEFO95238 335 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 IGKV1-16P04430 117 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 TPT1P13693 172 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
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CAPNS1-207ENST00000589146 RAB13P51153 203 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 CAV2P51636 162 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 DLX1P56177 255 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 LCN2P80188 198 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 OR4A47Q6IF82 309 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 OR4A16Q8NH70 328 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 BET1LQ9NYM9 111 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 COL12A1Q99715 3063 aa18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 SPCS3P61009 180 aa18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 NHLH2Q02577 135 aa18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF787Q6DD87 383 aa18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 SSX9Q7RTT3 188 aa18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 BAP18Q8IXM2 172 aa18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 OR4C13Q8NGP0 309 aa18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 PSENENQ9NZ42 101 aa18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 C15orf61A6NNL5 157 aa18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 UPK2O00526 184 aa18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 JTBO76095 146 aa18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 HTR2BP41595 481 aa18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 VMO1Q7Z5L0 202 aa18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 NRGNQ92686 78 aa18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 PERPQ96FX8 193 aa18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 ARV1Q9H2C2 271 aa18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 WFDC1Q9HC57 220 aa18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 SIRT7Q9NRC8 400 aa18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM14BQ9NUH8 114 aa18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 AKAP6Q13023 2319 aa18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 LRRK2Q5S007 2527 aa18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 TRAV3A0A0B4J244 114 aa18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 LEUTXA8MZ59 168 aa18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 H7C2Y5 167 aa18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 ARG1P05089 322 aa18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 IAPPP10997 89 aa18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 COL8A1P27658 744 aa18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 HTR1DP28221 377 aa18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 CLLU1Q5K131 121 aa18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 STPG2Q8N412 459 aa18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 UBAC2Q8NBM4 344 aa18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 OR4A5Q8NH83 315 aa18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 MMP26Q9NRE1 261 aa18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 DPM3Q9P2X0 92 aa18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 PRNDQ9UKY0 176 aa18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa18.41■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa18.41■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM157AC9JC47 383 aa18.41■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 SHOXO15266 292 aa18.41■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 SULT1A1P50225 295 aa18.41■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 ALKAL2Q6UX46 152 aa18.41■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 DTD1Q8TEA8 209 aa18.41■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 RPEQ96AT9 228 aa18.41■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 HARBI1Q96MB7 349 aa18.41■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 INSIG2Q9Y5U4 225 aa18.41■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa18.41■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 FGF2P09038 288 aa18.4■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC25A16P16260 332 aa18.4■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 CEACAM3P40198 252 aa18.4■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 LGALS7P47929 136 aa18.4■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 OR2B8PP59922 312 aa18.4■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa18.4■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 CLEC9AQ6UXN8 241 aa18.4■□□□□ 0.54
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