RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493853.1

RBM39-238, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 4

Gene RBM39, Length 567 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-238	ENST00000493853	CRHBP	P24387	322 aa		5.8	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	MAP2K4	P45985	399 aa		5.8	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	ARL6IP1	Q15041	203 aa		5.8	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		5.8	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		5.8	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		5.8	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	IGSF11	Q5DX21	431 aa		5.8	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		5.8	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		5.8	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		5.8	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	CNBD2	Q96M20	576 aa		5.8	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	HARBI1	Q96MB7	349 aa		5.8	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	RCHY1	Q96PM5	261 aa		5.8	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	GPHA2	Q96T91	129 aa		5.8	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	GFI1	Q99684	422 aa		5.8	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		5.8	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	PALMD	Q9NP74	551 aa		5.8	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	COA4	Q9NYJ1	87 aa		5.8	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		5.79	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		5.79	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	IFITM5	A6NNB3	132 aa		5.79	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853		H0Y980	276 aa		5.79	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	ACTL6B	O94805	426 aa		5.79	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	FCGR3A	P08637	254 aa		5.79	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		5.79	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	GSTT2	P0CG29	244 aa		5.79	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	GSTT2B	P0CG30	244 aa		5.79	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	RAB3B	P20337	219 aa		5.79	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		5.79	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	FHL2	Q14192	279 aa		5.79	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	TNXA	Q16473	311 aa		5.79	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		5.79	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		5.79	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	NRG4	Q8WWG1	115 aa		5.79	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		5.79	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		5.79	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	USMG5	Q96IX5	58 aa		5.79	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		5.79	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		5.79	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		5.79	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		5.79	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853		A0A0B4J203	849 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	MSGN1	A6NI15	193 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853		J3QRK9	145 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	LDLRAD4	O15165	306 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	DIRAS3	O95661	229 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	CRYZL1	O95825	349 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	IGLV2-23	P01705	113 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	CTXN2	P0C2S0	81 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	APELA	P0DMC3	54 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	LYL1	P12980	280 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	OR10A3	P58181	314 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	RPEL1	Q2QD12	228 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	CDNF	Q49AH0	187 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	TEX45	Q8NA69	505 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	MUC7	Q8TAX7	377 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	SNAPC3	Q92966	411 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	TUBA4B	Q9H853	241 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RBM39-238	ENST00000493853	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	RAB27B	O00194	218 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	TUSC2	O75896	110 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	SCGN	O76038	276 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	SLC22A5	O76082	557 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	IGLV1-51	P01701	117 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	DTYMK	P23919	212 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	SYNJ2BP	P57105	145 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	UBE2K	P61086	200 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	ATP5G2	Q06055	141 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	PLA2G7	Q13093	441 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	GAGE13	Q4V321	117 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	C22orf42	Q6IC83	251 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	LCN12	Q6JVE5	192 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	SPIN2A	Q99865	258 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	PEMT	Q9UBM1	199 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	SMIM30	A4D0T7	59 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	DPPA5	A6NC42	116 aa		5.76	□□□□□ -1.49

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