RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334414.10

PTPRB-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 12,316 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-202ENST00000334414 RPS27P42677 84 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 TNFRSF19Q9NS68 423 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 INSIG2Q9Y5U4 225 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 F2Z2F3 143 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 UBE2V1Q13404 147 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 Q5PR19 223 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 RNF182Q8N6D2 247 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 TNFRSF14Q92956 283 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
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PTPRB-202ENST00000334414 SLC25A38Q96DW6 304 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 GFRA4Q9GZZ7 299 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRB-202ENST00000334414 NRN1Q9NPD7 142 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 TRIP11Q15643 1979 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRB-202ENST00000334414 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRB-202ENST00000334414 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 IGHV3-43DP0DP04 118 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 HIST3H2BBQ8N257 126 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRB-202ENST00000334414 FAM117AQ9C073 453 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 WNT5AP41221 380 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 ZNF585BQ52M93 769 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 SCGB3A1Q96QR1 104 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 GBF1Q92538 1859 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 NEGR1Q7Z3B1 354 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 OR52M1Q8NGK5 317 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRB-202ENST00000334414 TM4SF5O14894 197 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 GRIFINA4D1Z8 144 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 CD5P06127 495 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 UMODP07911 640 aa4.74□□□□□ -1.65
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PTPRB-202ENST00000334414 MIC13Q5XKP0 118 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 RFLNAQ6ZTI6 216 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 DTX1Q86Y01 620 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 OR11H4Q8NGC9 324 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 DYNLRB2Q8TF09 96 aa4.74□□□□□ -1.65
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PTPRB-202ENST00000334414 F8W1H4 67 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 P2RY6Q15077 328 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 NEU1Q99519 415 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 SBF2Q86WG5 1849 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 LOC285556D6RIA3 1793 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa4.74□□□□□ -1.65
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PTPRB-202ENST00000334414 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 DEFB127Q9H1M4 99 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 KLF12Q9Y4X4 402 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 FBXW9Q5XUX1 488 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 FAM159AQ6UWV7 190 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa4.74□□□□□ -1.65
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PTPRB-202ENST00000334414 FSCN3Q9NQT6 498 aa4.74□□□□□ -1.65
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PTPRB-202ENST00000334414 DEFB108BQ8NET1 73 aa4.74□□□□□ -1.65
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PTPRB-202ENST00000334414 SLC25A15Q9Y619 301 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 GGTLC3B5MD39 225 aa4.74□□□□□ -1.65
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PTPRB-202ENST00000334414 LEPP41159 167 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 MMDQ15546 238 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 LINC01555Q8NAE3 123 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 OR5AN1Q8NGI8 311 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 TMUB1Q9BVT8 246 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 OTORQ9NRC9 128 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 TMEM160Q9NX00 188 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 MMP23AO75900 390 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 FUT5Q11128 374 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-202ENST00000334414 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
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