RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025262.5

Ltb-201, Transcript of Lymphotoxin-beta, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ltb, Length 1,160 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tas2r3Q7TQA7 316 aa14.85□□□□□ -0.03
Ltb-201ENSMUST00000025262 TigarQ8BZA9 269 aa14.85□□□□□ -0.03
Ltb-201ENSMUST00000025262 Olfr530Q8VFE8 307 aa14.85□□□□□ -0.03
Ltb-201ENSMUST00000025262 Olfr1163Q8VFR4 316 aa14.85□□□□□ -0.03
Ltb-201ENSMUST00000025262 B3gnt9Q8VI16 399 aa14.85□□□□□ -0.03
Ltb-201ENSMUST00000025262 Exosc4Q921I9 245 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
Ltb-201ENSMUST00000025262 Slc31a2Q9CPU9 143 aa14.85□□□□□ -0.03
Ltb-201ENSMUST00000025262 Commd4Q9CQ02 199 aa14.85□□□□□ -0.03
Ltb-201ENSMUST00000025262 Eaf1Q9D4C5 268 aa14.85□□□□□ -0.03
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tex36Q9D5N9 219 aa14.85□□□□□ -0.03
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fabp12Q9DAK4 132 aa14.85□□□□□ -0.03
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ropn1lQ9EQ00 218 aa14.85□□□□□ -0.03
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cldn15Q9Z0S5 227 aa14.85□□□□□ -0.03
Ltb-201ENSMUST00000025262 Olfr1107A2AVB8 312 aa14.84□□□□□ -0.03
Ltb-201ENSMUST00000025262 Olfr1224-ps1A3KGY4 311 aa14.84□□□□□ -0.03
Ltb-201ENSMUST00000025262 Lin7cO88952 197 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
Ltb-201ENSMUST00000025262 P01820 115 aa14.84□□□□□ -0.03
Ltb-201ENSMUST00000025262 UbdP63072 162 aa14.84□□□□□ -0.03
Ltb-201ENSMUST00000025262 Trdv4Q5R1A3 115 aa14.84□□□□□ -0.03
Ltb-201ENSMUST00000025262 Klra4Q60651 263 aa14.84□□□□□ -0.03
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rnf183Q8QZS5 190 aa14.84□□□□□ -0.03
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cysltr2Q920A1 309 aa14.84□□□□□ -0.03
Ltb-201ENSMUST00000025262 Nek6Q9ES70 313 aa14.84□□□□□ -0.03
Ltb-201ENSMUST00000025262 Olfr1314A2AVL6 312 aa14.83□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm28048F7BCN0 99 aa14.83□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Alx4O35137 399 aa14.83□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Apoc1P34928 88 aa14.83□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ccdc115Q8VE99 180 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Olfr575Q8VH16 318 aa14.83□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tmem37Q9JJV3 211 aa14.83□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pla2g1bQ9Z0Y2 146 aa14.83□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm14444A2ARW3 426 aa14.82□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rnf212bD3Z423 297 aa14.82□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fbxw28E9Q8A4 466 aa14.82□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm6614M0QWR8 670 aa14.82□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Psmb10O35955 273 aa14.82□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Csf3P09920 208 aa14.82□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sesn1P58006 492 aa14.82□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Wnt10aP70701 417 aa14.82□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Spin2cQ6NVE3 257 aa14.82□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Phf21aQ6ZPK0 659 aa14.82□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tm7sf2Q71KT5 418 aa14.82□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pqlc1Q80XM9 271 aa14.82□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Egln3Q91UZ4 239 aa14.82□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Dnmt3lQ9CWR8 421 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 CrygfQ9CXV3 174 aa14.82□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Nos1apQ9D3A8 503 aa14.82□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Actrt1Q9D9J3 376 aa14.82□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 AgkQ9ESW4 421 aa14.82□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Kcnip1Q9JJ57 227 aa14.82□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ighv12-3A0A075B5T1 117 aa14.81□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Dcst2A0A140LIJ0 701 aa14.81□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Olfr1293-psA0A1L1SVB5 326 aa14.81□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm20509G3UZF1 325 aa14.81□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tmem178bM0QWJ9 172 aa14.81□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ucp1P12242 307 aa14.81□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gpr83P30731 423 aa14.81□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Foxa2P35583 459 aa14.81□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Slc1a3P56564 543 aa14.81□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pax5Q02650 391 aa14.81□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Eri1Q7TMF2 345 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Olfr1463Q7TQR3 310 aa14.81□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rnf170Q8CBG9 286 aa14.81□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Depp1Q8K2F3 205 aa14.81□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 H1fooQ8VIK3 304 aa14.81□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Il24Q925S4 181 aa14.81□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm17509Q9CZ61 145 aa14.81□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tmem210Q9D2F0 147 aa14.81□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 AspdhQ9DCQ2 287 aa14.81□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 BvesQ9ES83 358 aa14.81□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ighv1-7A0A075B5T7 117 aa14.8□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 AI182371A2AS37 356 aa14.8□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Zfp563B8JJZ9 448 aa14.8□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Vmn2r83E9Q0G7 864 aa14.8□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm2564F6Z9S8 108 aa14.8□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ccl19O70460 108 aa14.8□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Chst3O88199 472 aa14.8□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 GzmfP08883 248 aa14.8□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Bst1Q64277 311 aa14.8□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cnih3Q6ZWS4 160 aa14.8□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Olfr1321Q7TQW4 319 aa14.8□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Kctd9Q80UN1 339 aa14.8□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Scgb2b26Q8JZX1 112 aa14.8□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mcrip2Q9CQB2 160 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tex43Q9D9I1 141 aa14.8□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fhl3Q9R059 289 aa14.8□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ighv14-2A0A075B5R7 117 aa14.79□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Igkv1-135A0A0B4J1H7 120 aa14.79□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Olfr592E9PYB3 312 aa14.79□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Btbd16E9Q173 522 aa14.79□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Vmn1r67G5E8C1 305 aa14.79□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Olfr194L7N1Y8 306 aa14.79□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Olfr92L7N475 312 aa14.79□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 MfngO09008 321 aa14.79□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 PpibP24369 216 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Atp6v1e1P50518 226 aa14.79□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Barhl1P63157 327 aa14.79□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 SelenoiQ80TA1 398 aa14.79□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Lgi3Q8K406 548 aa14.79□□□□□ -0.04
Ltb-201ENSMUST00000025262 Olfr1350Q8VF34 308 aa14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28 ms