Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Apoc1P34928 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Apoc1P34928 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Apoc1P34928 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Apoc1P34928 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Apoc1P34928 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Apoc1P34928 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Apoc1P34928 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Apoc1P34928 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Apoc1P34928 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Apoc1P34928 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Apoc1P34928 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Apoc1P34928 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Apoc1P34928 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Apoc1P34928 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Apoc1P34928 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Apoc1P34928 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Apoc1P34928 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Apoc1P34928 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Apoc1P34928 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Apoc1P34928 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Apoc1P34928 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Apoc1P34928 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Apoc1P34928 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Apoc1P34928 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Apoc1P34928 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Apoc1P34928 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Apoc1P34928 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Apoc1P34928 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Apoc1P34928 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Apoc1P34928 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Apoc1P34928 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Apoc1P34928 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Apoc1P34928 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Apoc1P34928 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Apoc1P34928 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Apoc1P34928 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Apoc1P34928 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Apoc1P34928 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Apoc1P34928 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Apoc1P34928 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Apoc1P34928 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Apoc1P34928 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Apoc1P34928 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Apoc1P34928 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Apoc1P34928 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Apoc1P34928 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Apoc1P34928 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Apoc1P34928 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Apoc1P34928 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Apoc1P34928 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Apoc1P34928 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Apoc1P34928 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Apoc1P34928 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Apoc1P34928 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Apoc1P34928 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Apoc1P34928 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Apoc1P34928 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Apoc1P34928 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Apoc1P34928 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Apoc1P34928 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apoc1P34928 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apoc1P34928 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Apoc1P34928 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Apoc1P34928 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Apoc1P34928 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apoc1P34928 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apoc1P34928 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apoc1P34928 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apoc1P34928 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apoc1P34928 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apoc1P34928 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apoc1P34928 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apoc1P34928 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Apoc1P34928 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Apoc1P34928 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Apoc1P34928 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Apoc1P34928 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Apoc1P34928 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Apoc1P34928 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Apoc1P34928 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apoc1P34928 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Apoc1P34928 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Apoc1P34928 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apoc1P34928 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Apoc1P34928 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apoc1P34928 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apoc1P34928 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apoc1P34928 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apoc1P34928 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apoc1P34928 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Apoc1P34928 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apoc1P34928 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Apoc1P34928 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Apoc1P34928 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Apoc1P34928 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Apoc1P34928 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Apoc1P34928 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Apoc1P34928 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Apoc1P34928 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms