Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30,87■■■□□ 2,53
Commd4Q9CQ02 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Commd4Q9CQ02 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Commd4Q9CQ02 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,51■■■□□ 2,31
Commd4Q9CQ02 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28,53■■■□□ 2,16
Commd4Q9CQ02 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Commd4Q9CQ02 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Commd4Q9CQ02 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Commd4Q9CQ02 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Commd4Q9CQ02 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Commd4Q9CQ02 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27,76■■■□□ 2,03
Commd4Q9CQ02 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Commd4Q9CQ02 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Commd4Q9CQ02 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,99
Commd4Q9CQ02 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27,37■■□□□ 1,97
Commd4Q9CQ02 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Commd4Q9CQ02 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Commd4Q9CQ02 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27,22■■□□□ 1,95
Commd4Q9CQ02 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Commd4Q9CQ02 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Commd4Q9CQ02 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Commd4Q9CQ02 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Commd4Q9CQ02 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Commd4Q9CQ02 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Commd4Q9CQ02 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Commd4Q9CQ02 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Commd4Q9CQ02 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Commd4Q9CQ02 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Commd4Q9CQ02 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26,54■■□□□ 1,84
Commd4Q9CQ02 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Commd4Q9CQ02 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26,42■■□□□ 1,82
Commd4Q9CQ02 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26,36■■□□□ 1,81
Commd4Q9CQ02 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Commd4Q9CQ02 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Commd4Q9CQ02 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Commd4Q9CQ02 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26,22■■□□□ 1,79
Commd4Q9CQ02 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Commd4Q9CQ02 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26,14■■□□□ 1,78
Commd4Q9CQ02 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26,01■■□□□ 1,75
Commd4Q9CQ02 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Commd4Q9CQ02 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25,98■■□□□ 1,75
Commd4Q9CQ02 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25,93■■□□□ 1,74
Commd4Q9CQ02 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Commd4Q9CQ02 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Commd4Q9CQ02 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Commd4Q9CQ02 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Commd4Q9CQ02 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Commd4Q9CQ02 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Commd4Q9CQ02 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Commd4Q9CQ02 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25,56■■□□□ 1,68
Commd4Q9CQ02 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Commd4Q9CQ02 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25,5■■□□□ 1,67
Commd4Q9CQ02 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Commd4Q9CQ02 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Commd4Q9CQ02 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Commd4Q9CQ02 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25,34■■□□□ 1,65
Commd4Q9CQ02 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25,29■■□□□ 1,64
Commd4Q9CQ02 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Commd4Q9CQ02 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Commd4Q9CQ02 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,25■■□□□ 1,63
Commd4Q9CQ02 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25,24■■□□□ 1,63
Commd4Q9CQ02 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Commd4Q9CQ02 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Commd4Q9CQ02 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Commd4Q9CQ02 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Commd4Q9CQ02 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Commd4Q9CQ02 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Commd4Q9CQ02 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Commd4Q9CQ02 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Commd4Q9CQ02 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Commd4Q9CQ02 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,02■■□□□ 1,6
Commd4Q9CQ02 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24,99■■□□□ 1,59
Commd4Q9CQ02 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Commd4Q9CQ02 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Commd4Q9CQ02 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Commd4Q9CQ02 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,87■■□□□ 1,57
Commd4Q9CQ02 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Commd4Q9CQ02 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Commd4Q9CQ02 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Commd4Q9CQ02 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Commd4Q9CQ02 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24,65■■□□□ 1,54
Commd4Q9CQ02 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Commd4Q9CQ02 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Commd4Q9CQ02 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,61■■□□□ 1,53
Commd4Q9CQ02 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Commd4Q9CQ02 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Commd4Q9CQ02 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Commd4Q9CQ02 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Commd4Q9CQ02 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Commd4Q9CQ02 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,49■■□□□ 1,51
Commd4Q9CQ02 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Commd4Q9CQ02 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Commd4Q9CQ02 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24,45■■□□□ 1,5
Commd4Q9CQ02 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
Commd4Q9CQ02 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Commd4Q9CQ02 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Commd4Q9CQ02 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Commd4Q9CQ02 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
Commd4Q9CQ02 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Commd4Q9CQ02 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24,31■■□□□ 1,48
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