Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H7

Igkv1-135, Immunoglobulin kappa variable 1-135 (Fragment), mousemouse

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Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30,19■■■□□ 2,42
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,94■■■□□ 2,06
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Igkv1-135A0A0B4J1H7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26,99■■□□□ 1,91
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26,93■■□□□ 1,9
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26,41■■□□□ 1,82
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Igkv1-135A0A0B4J1H7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26,19■■□□□ 1,78
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25,91■■□□□ 1,74
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Igkv1-135A0A0B4J1H7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25,41■■□□□ 1,66
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25,29■■□□□ 1,64
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25,21■■□□□ 1,63
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24,77■■□□□ 1,56
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24,75■■□□□ 1,55
Igkv1-135A0A0B4J1H7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24,75■■□□□ 1,55
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24,74■■□□□ 1,55
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24,72■■□□□ 1,55
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24,64■■□□□ 1,54
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,53
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24,23■■□□□ 1,47
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
Igkv1-135A0A0B4J1H7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24,12■■□□□ 1,45
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23,96■■□□□ 1,43
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23,96■■□□□ 1,43
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23,91■■□□□ 1,42
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,86■■□□□ 1,41
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,81■■□□□ 1,4
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,78■■□□□ 1,4
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23,77■■□□□ 1,4
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23,67■■□□□ 1,38
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23,65■■□□□ 1,38
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,38
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,64■■□□□ 1,37
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23,57■■□□□ 1,36
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Igkv1-135A0A0B4J1H7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23,45■■□□□ 1,34
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,34■■□□□ 1,33
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Igkv1-135A0A0B4J1H7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
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