RNA–Protein interactions for RNA: YOR118W

RTC5, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene RTC5, Length 1,704 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RTC5	YOR118W	MRS2	Q01926	470 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	DON1	Q05610	365 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	ECI1	Q05871	280 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	SOG2	Q08817	791 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	CDC8	P00572	216 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	SWI6	P09959	803 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	PRI2	P20457	528 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	CBF2	P32504	956 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	YKL077W	P36081	392 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	HIS2	P38635	335 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	SMC3	P47037	1230 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	VPS53	P47061	822 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	ORC5	P50874	479 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	SLD5	Q03406	294 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	PPM1	Q04081	328 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	YMR018W	Q04364	514 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	COQ9	Q05779	260 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	IES4	Q08561	116 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	SPO21	Q12411	609 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	CDC42	P19073	191 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	PEX2	P32800	271 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	MRX3	P38172	270 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	RRT2	P38332	387 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	ZAP1	P47043	880 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	CPR7	P47103	393 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	COS5	P47187	383 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	TPO2	P53283	614 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	RTT102	P53330	157 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	VTC3	Q02725	835 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	TDA9	Q04545	1251 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	HDA2	Q06629	674 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	OPI10	Q08202	246 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	ZRT2	Q12436	422 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	YLR462W	O13556	202 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	KAR3	P17119	729 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	YUR1	P26725	428 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	EUG1	P32474	517 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	COT1	P32798	439 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
RTC5	YOR118W	ATG19	P35193	415 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
RTC5	YOR118W	YHL049C	P38722	271 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	YEL075C	P39972	122 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	VAB2	P40003	282 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	YER189W	P40104	122 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	NEO1	P40527	1151 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	YFL064C	P43540	174 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	RPC17	P47076	161 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	GNP1	P48813	663 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	YGR125W	P53273	1036 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	RIP-Chip
RTC5	YOR118W	YNL146W	P53906	100 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	YMR102C	Q03177	834 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	YDR222W	Q04925	415 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	OMS1	Q06668	471 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	ACM1	Q08981	209 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	AIM41	Q12032	185 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
RTC5	YOR118W	BLI1	P35727	113 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	TVP38	P36164	337 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	GPB2	P39717	880 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	ASG1	P40467	964 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	YIL089W	P40500	205 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	EEB1	Q02891	456 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	KIN82	P25341	720 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	DEP1	P31385	405 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	NFU1	P32860	256 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	RDH54	P38086	958 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	FLR1	P38124	548 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	END3	P39013	349 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	EAF5	P39995	279 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	NPP2	P39997	493 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	YTA12	P40341	825 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	LEM3	P42838	414 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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