RNA–Protein interactions for RNA: YNL046W

YNL046W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YNL046W, Length 519 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL046W	YNL046W	YLR407W	Q06070	228 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YNL046W	YNL046W	ZPS1	Q12512	249 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YNL046W	YNL046W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
YNL046W	YNL046W	TUP1	P16649	713 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YNL046W	YNL046W	IME1	P21190	360 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YNL046W	YNL046W	THI4	P32318	326 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YNL046W	YNL046W	IRC8	P47046	822 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YNL046W	YNL046W	YMR210W	Q03649	449 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YNL046W	YNL046W	YPS7	Q06325	596 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YNL046W	YNL046W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
YNL046W	YNL046W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
YNL046W	YNL046W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	3.69	□□□□□ -1.82
YNL046W	YNL046W	AQY1	P0CD91	305 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YNL046W	YNL046W	RGT1	P32862	1170 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YNL046W	YNL046W	MAL31	P38156	614 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YNL046W	YNL046W	PIH1	P38768	344 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YNL046W	YNL046W	PPE1	P38796	400 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YNL046W	YNL046W	BUD8	P41698	603 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YNL046W	YNL046W	THI6	P41835	540 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YNL046W	YNL046W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
YNL046W	YNL046W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
YNL046W	YNL046W	MRPL9	P31334	269 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YNL046W	YNL046W	NMD5	P46970	1048 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YNL046W	YNL046W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
YNL046W	YNL046W	MFM1	Q02783	413 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YNL046W	YNL046W	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
YNL046W	YNL046W	MRPL7	P36519	292 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YNL046W	YNL046W	PXA1	P41909	870 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YNL046W	YNL046W	SPO1	P53541	631 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YNL046W	YNL046W	YNL018C	P53976	612 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YNL046W	YNL046W	TIM50	Q02776	476 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YNL046W	YNL046W	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	3.67	□□□□□ -1.82
YNL046W	YNL046W	ATG36	P46983	293 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YNL046W	YNL046W	YJL043W	P47053	257 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YNL046W	YNL046W	MET13	P53128	600 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YNL046W	YNL046W	RSC9	Q03124	581 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YNL046W	YNL046W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
YNL046W	YNL046W	GUD1	Q07729	489 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YNL046W	YNL046W	NTG2	Q08214	380 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YNL046W	YNL046W	CNE1	P27825	502 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	EUG1	P32474	517 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	RPC34	P32910	317 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	3.65	□□□□□ -1.83	not detected
YNL046W	YNL046W	SNO3	P43544	222 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	BFA1	P47113	574 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	COQ6	P53318	479 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	BUD17	P53727	317 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	FDC1	Q03034	503 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	STP4	Q07351	490 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	YLR001C	Q07895	862 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	BST1	P43571	1029 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	YDL073W	Q07454	984 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	TSR4	P25040	408 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	APD1	P38281	316 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	EXO1	P39875	702 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	MNT3	P40549	630 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	RNH70	P53331	553 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	3.63	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	YPL216W	Q08964	1102 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	WHI2	P12611	486 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	PRE4	P30657	266 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	JHD1	P40034	492 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	FTR1	P40088	404 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	YFL015C	P43578	164 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	PPN1	Q04119	674 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	SWI6	P09959	803 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	ASK1	P35734	292 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	CDS1	P38221	457 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	PCI8	P40512	444 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	PXL1	P36166	706 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	TDA3	P38758	523 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	3.6	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	BSP1	Q06604	576 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	YLR111W	Q12528	110 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.59	□□□□□ -1.83	not detected
YNL046W	YNL046W	GSY2	P27472	705 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	BRN1	P38170	754 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	SPC97	P38863	823 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	DUN1	P39009	513 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	OPT1	P40897	799 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	RET2	P43621	546 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	TAF4	P50105	388 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	ALG12	P53730	551 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	DOS2	P54858	310 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	TFB2	Q02939	513 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	HLR1	Q04429	423 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	CRC1	Q12289	327 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YNL046W	YNL046W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 23.2 ms