RNA–Protein interactions for RNA: YKL021C

MAK11, Transcript of Protein involved in an early step of 60S ribosomal subunit biogenesis, yeast

Gene MAK11, Length 1,407 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MAK11	YKL021C	FTR1	P40088	404 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MAK11	YKL021C	YPR027C	Q12079	277 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MAK11	YKL021C	ADY2	P25613	283 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MAK11	YKL021C	NTH1	P32356	751 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MAK11	YKL021C	YIL166C	P40445	542 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MAK11	YKL021C	FDC1	Q03034	503 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MAK11	YKL021C	RMP1	Q12530	201 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MAK11	YKL021C	FLO10	P36170	1169 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MAK11	YKL021C	YMC2	P38087	329 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MAK11	YKL021C	YBR071W	P38243	211 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MAK11	YKL021C	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MAK11	YKL021C	MUP3	P38734	546 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MAK11	YKL021C	YDL183C	P48569	320 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MAK11	YKL021C	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MAK11	YKL021C	DIP5	P53388	608 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MAK11	YKL021C	SKY1	Q03656	742 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MAK11	YKL021C	HLR1	Q04429	423 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MAK11	YKL021C	PHO5	P00635	467 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MAK11	YKL021C	PPZ2	P33329	710 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MAK11	YKL021C	YHR033W	P38690	423 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MAK11	YKL021C	YEL020C	P39994	560 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MAK11	YKL021C	ATF1	P40353	525 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MAK11	YKL021C	COG6	P53959	839 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MAK11	YKL021C	GIS1	Q03833	894 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MAK11	YKL021C	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MAK11	YKL021C	TRE2	Q08693	809 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MAK11	YKL021C	HMG2	P12684	1045 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MAK11	YKL021C	AEP2	P22136	580 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MAK11	YKL021C	KCC4	P25389	1037 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MAK11	YKL021C	MRPL7	P36519	292 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MAK11	YKL021C	APL3	P38065	1025 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MAK11	YKL021C	EHT1	P38295	451 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MAK11	YKL021C	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MAK11	YKL021C	PMT6	P42934	759 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MAK11	YKL021C	SPC98	P53540	846 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MAK11	YKL021C	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MAK11	YKL021C	UFO1	Q04511	668 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MAK11	YKL021C	STE4	P18851	423 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MAK11	YKL021C	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MAK11	YKL021C	ARO10	Q06408	635 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MAK11	YKL021C	YCG1	Q06680	1035 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MAK11	YKL021C	STE12	P13574	688 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MAK11	YKL021C	DGR2	P32330	852 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MAK11	YKL021C	PAF1	P38351	445 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MAK11	YKL021C	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MAK11	YKL021C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MAK11	YKL021C	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MAK11	YKL021C	SPO11	P23179	398 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MAK11	YKL021C	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MAK11	YKL021C	PEX2	P32800	271 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MAK11	YKL021C	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MAK11	YKL021C	IRC5	P43610	853 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MAK11	YKL021C	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MAK11	YKL021C	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MAK11	YKL021C	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MAK11	YKL021C	PPE1	P38796	400 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MAK11	YKL021C	EAF5	P39995	279 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MAK11	YKL021C	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MAK11	YKL021C	TRS23	Q03784	219 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MAK11	YKL021C	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MAK11	YKL021C	RPN13	O13563	156 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MAK11	YKL021C	TPK2	P06245	380 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MAK11	YKL021C	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MAK11	YKL021C	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MAK11	YKL021C	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MAK11	YKL021C	YEL076C	P39971	216 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MAK11	YKL021C	MRK1	P50873	501 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MAK11	YKL021C	AIM41	Q12032	185 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MAK11	YKL021C	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MAK11	YKL021C	PLC1	P32383	869 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MAK11	YKL021C	TFC4	P33339	1025 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MAK11	YKL021C	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MAK11	YKL021C	PEA2	P40091	420 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MAK11	YKL021C	LRO1	P40345	661 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MAK11	YKL021C	YIP4	P53093	235 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MAK11	YKL021C	SPC105	P53148	917 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MAK11	YKL021C	PEF1	P53238	335 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MAK11	YKL021C	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MAK11	YKL021C	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MAK11	YKL021C	ARR3	Q06598	404 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MAK11	YKL021C	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MAK11	YKL021C	YPT53	P36019	220 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MAK11	YKL021C	PAC2	P39937	518 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MAK11	YKL021C	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MAK11	YKL021C	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MAK11	YKL021C	YOR378W	Q08902	515 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MAK11	YKL021C	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MAK11	YKL021C	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MAK11	YKL021C	HOP1	P20050	605 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MAK11	YKL021C	YMC1	P32331	307 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MAK11	YKL021C	IMO32	P53219	342 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MAK11	YKL021C	FOL1	P53848	824 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MAK11	YKL021C	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MAK11	YKL021C	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MAK11	YKL021C	MFM1	Q02783	413 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MAK11	YKL021C	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MAK11	YKL021C	MRC1	P25588	1096 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MAK11	YKL021C	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MAK11	YKL021C	MNT2	P53059	558 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MAK11	YKL021C	PEX14	P53112	341 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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