RNA–Protein interactions for RNA: YJL109C

UTP10, Transcript of Nucleolar protein, yeast

Gene UTP10, Length 5,310 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UTP10	YJL109C	WAR1	Q03631	944 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	NHX1	Q04121	633 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	UBX2	Q04228	584 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	KRE28	Q04431	385 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	YLR455W	Q06188	304 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	PUN1	Q06991	263 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	PCL8	Q08966	492 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	YDL176W	Q12027	708 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	HMI1	Q12039	706 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	TGL5	Q12043	749 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	DIN7	Q12086	430 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	VAM3	Q12241	283 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	LCB4	Q12246	624 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	NTO1	Q12311	748 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	YDL206W	Q12424	762 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	ARP6	Q12509	438 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	COQ4	O13525	335 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	YLR415C	O13578	112 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	PCT1	P13259	424 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	SAC7	P17121	654 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	RPO26	P20435	155 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	YJU3	P28321	313 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	AFG1	P32317	509 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	CYM1	P32898	989 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	STE5	P32917	917 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	TRM2	P33753	639 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	BET3	P36149	193 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	APD1	P38281	316 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	SAF1	P38352	637 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	RIM4	P38741	713 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	MLH1	P38920	769 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	EAF5	P39995	279 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	FMP10	P40098	244 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	QDR2	P40474	542 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	PRM2	P40534	656 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	HUL4	P40985	892 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	YFL052W	P43551	465 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	YDL183C	P48569	320 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	ALT2	P52892	507 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	RIM8	P53179	542 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	YGR012W	P53206	393 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	SNO2	P53823	222 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	SFB2	P53953	876 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	RCM1	P53972	490 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	GCR2	Q01722	534 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	TBF1	Q02457	562 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	YML131W	Q03102	365 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	ATG16	Q03818	150 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	YDR444W	Q04093	687 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	YDR514C	Q04408	483 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	AIM32	Q04689	311 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	COG4	Q06096	861 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	EST2	Q06163	884 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	ATG33	Q06485	197 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	ERF2	Q06551	359 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	NTG2	Q08214	380 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	YOL075C	Q08234	1294 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	ALE1	Q08548	619 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	MET32	Q12041	191 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	ELG1	Q12050	791 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	HAT1	Q12341	374 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	ZRT2	Q12436	422 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	YOR131C	Q12486	218 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	RPN13	O13563	156 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	YLR358C	O13565	187 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	GAL1	P04385	528 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	SPT3	P06844	337 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	STE12	P13574	688 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	PET123	P17558	318 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	ARG8	P18544	423 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	MRPS28	P21771	286 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	ESS1	P22696	170 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	MSH3	P25336	1018 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	ARE1	P25628	610 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	RSC6	P25632	483 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	KIP2	P28743	706 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	PAH1	P32567	862 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	SRB5	P32585	307 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	MDL1	P33310	695 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	LOT5	P34234	306 aa		0.61	□□□□□ -2.31
UTP10	YJL109C	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31

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