RNA–Protein interactions for RNA: YHL009W-A

YHL009W-A, Transcript of Retrotransposon TYA Gag gene co-transcribed with TYB Pol, yeastyeast

Gene YHL009W-A, Length 1,242 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL009W-AYHL009W-A YAP1P19880 650 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
YHL009W-AYHL009W-A YIP4P53093 235 aa3.62□□□□□ -1.83
YHL009W-AYHL009W-A COQ6P53318 479 aa3.62□□□□□ -1.83
YHL009W-AYHL009W-A MFM1Q02783 413 aa3.62□□□□□ -1.83
YHL009W-AYHL009W-A ENT2Q05785 613 aa3.62□□□□□ -1.83
YHL009W-AYHL009W-A YDL073WQ07454 984 aa3.62□□□□□ -1.83
YHL009W-AYHL009W-A YMR084WA2P2R3 262 aa3.61□□□□□ -1.83
YHL009W-AYHL009W-A SRD1P09007 221 aa3.61□□□□□ -1.83
YHL009W-AYHL009W-A PPE1P38796 400 aa3.61□□□□□ -1.83
YHL009W-AYHL009W-A EXO1P39875 702 aa3.61□□□□□ -1.83
YHL009W-AYHL009W-A YAT2P40017 923 aa3.61□□□□□ -1.83
YHL009W-AYHL009W-A CHZ1P40019 153 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
YHL009W-AYHL009W-A TMN3P40071 706 aa3.61□□□□□ -1.83
YHL009W-AYHL009W-A BST1P43571 1029 aa3.61□□□□□ -1.83
YHL009W-AYHL009W-A YNL018CP53976 612 aa3.61□□□□□ -1.83
YHL009W-AYHL009W-A PRP22P24384 1145 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
YHL009W-AYHL009W-A NUG1P40010 520 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
YHL009W-AYHL009W-A HER1Q12276 1246 aa3.6□□□□□ -1.83
YHL009W-AYHL009W-A WHI2P12611 486 aa3.59□□□□□ -1.83
YHL009W-AYHL009W-A IMG2P25642 146 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
YHL009W-AYHL009W-A CNE1P27825 502 aa3.59□□□□□ -1.83
YHL009W-AYHL009W-A OPT1P40897 799 aa3.59□□□□□ -1.83
YHL009W-AYHL009W-A AIM14P53109 570 aa3.59□□□□□ -1.83
YHL009W-AYHL009W-A MRPL1Q04599 285 aa3.59□□□□□ -1.83
YHL009W-AYHL009W-A BSP1Q06604 576 aa3.59□□□□□ -1.83
YHL009W-AYHL009W-A DCS2Q12123 353 aa3.59□□□□□ -1.83
YHL009W-AYHL009W-A SEC3P33332 1336 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
YHL009W-AYHL009W-A MGM1P32266 881 aa3.58□□□□□ -1.84
YHL009W-AYHL009W-A YKR075CP36155 307 aa3.58□□□□□ -1.84
YHL009W-AYHL009W-A EFR3Q03653 782 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
YHL009W-AYHL009W-A ATG33Q06485 197 aa3.58□□□□□ -1.84
YHL009W-AYHL009W-A YPL216WQ08964 1102 aa3.58□□□□□ -1.84
YHL009W-AYHL009W-A STI1P15705 589 aaKnown RBP RIP-Chip data3.57□□□□□ -1.84not detected
YHL009W-AYHL009W-A MEF1P25039 761 aa3.57□□□□□ -1.84
YHL009W-AYHL009W-A RCR2Q03446 210 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
YHL009W-AYHL009W-A CEF1Q03654 590 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
YHL009W-AYHL009W-A GIN4Q12263 1142 aa3.57□□□□□ -1.84
YHL009W-AYHL009W-A RDL1Q12305 139 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
YHL009W-AYHL009W-A YOR111WQ99210 232 aa3.57□□□□□ -1.84
YHL009W-AYHL009W-A YMR085WP0CF18 432 aa3.56□□□□□ -1.84
YHL009W-AYHL009W-A HMG1P12683 1054 aa3.56□□□□□ -1.84
YHL009W-AYHL009W-A YIL024CP40543 189 aa3.56□□□□□ -1.84
YHL009W-AYHL009W-A NOP7P53261 605 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
YHL009W-AYHL009W-A BUD17P53727 317 aa3.56□□□□□ -1.84
YHL009W-AYHL009W-A YMR210WQ03649 449 aa3.56□□□□□ -1.84
YHL009W-AYHL009W-A GFD1Q04839 188 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
YHL009W-AYHL009W-A NSE3Q05541 303 aa3.56□□□□□ -1.84
YHL009W-AYHL009W-A BUD7Q08754 746 aa3.56□□□□□ -1.84
YHL009W-AYHL009W-A GSY2P27472 705 aa3.55□□□□□ -1.84
YHL009W-AYHL009W-A SRP40P32583 406 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
YHL009W-AYHL009W-A MRPL7P36519 292 aa3.55□□□□□ -1.84
YHL009W-AYHL009W-A FLO5P38894 1075 aa3.55□□□□□ -1.84
YHL009W-AYHL009W-A BEM4P39011 633 aa3.55□□□□□ -1.84
YHL009W-AYHL009W-A YMR124WP39523 943 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
YHL009W-AYHL009W-A PXA1P41909 870 aa3.55□□□□□ -1.84
YHL009W-AYHL009W-A YFL015CP43578 164 aa3.55□□□□□ -1.84
YHL009W-AYHL009W-A COG8Q04632 607 aa3.55□□□□□ -1.84
YHL009W-AYHL009W-A YOR131CQ12486 218 aa3.55□□□□□ -1.84
YHL009W-AYHL009W-A YLR111WQ12528 110 aa3.55□□□□□ -1.84
YHL009W-AYHL009W-A YKU70P32807 602 aa3.54□□□□□ -1.84
YHL009W-AYHL009W-A SCW10Q04951 389 aa3.54□□□□□ -1.84
YHL009W-AYHL009W-A SRL1Q08673 210 aa3.54□□□□□ -1.84
YHL009W-AYHL009W-A RNR3P21672 869 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
YHL009W-AYHL009W-A SSD1P24276 1250 aaKnown RBP RIP-Chip data3.53□□□□□ -1.84not detected
YHL009W-AYHL009W-A MAL31P38156 614 aa3.53□□□□□ -1.84
YHL009W-AYHL009W-A OAF1P39720 1047 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
YHL009W-AYHL009W-A YGR054WP53235 642 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
YHL009W-AYHL009W-A FDC1Q03034 503 aa3.53□□□□□ -1.84
YHL009W-AYHL009W-A YLR407WQ06070 228 aa3.53□□□□□ -1.84
YHL009W-AYHL009W-A TPO3Q06451 622 aa3.53□□□□□ -1.84
YHL009W-AYHL009W-A SNA4Q07549 140 aa3.53□□□□□ -1.84
YHL009W-AYHL009W-A NDD1Q08887 554 aa3.53□□□□□ -1.84
YHL009W-AYHL009W-A TGS1Q12052 315 aa3.53□□□□□ -1.84
YHL009W-AYHL009W-A PCL2P25693 308 aa3.52□□□□□ -1.85
YHL009W-AYHL009W-A PCM1P38628 557 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
YHL009W-AYHL009W-A BUD8P41698 603 aa3.52□□□□□ -1.85
YHL009W-AYHL009W-A BFA1P47113 574 aa3.52□□□□□ -1.85
YHL009W-AYHL009W-A SPO1P53541 631 aa3.52□□□□□ -1.85
YHL009W-AYHL009W-A TIM50Q02776 476 aa3.52□□□□□ -1.85
YHL009W-AYHL009W-A YER190C-BP0CX94 160 aa3.51□□□□□ -1.85
YHL009W-AYHL009W-A YEL077W-AP0CX95 160 aa3.51□□□□□ -1.85
YHL009W-AYHL009W-A YGR296C-BP0CX96 160 aa3.51□□□□□ -1.85
YHL009W-AYHL009W-A YPL283W-BP0CX97 160 aa3.51□□□□□ -1.85
YHL009W-AYHL009W-A YPR204C-AP0CX98 160 aa3.51□□□□□ -1.85
YHL009W-AYHL009W-A IME1P21190 360 aa3.51□□□□□ -1.85
YHL009W-AYHL009W-A ENP2P48234 707 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
YHL009W-AYHL009W-A WAR1Q03631 944 aa3.51□□□□□ -1.85
YHL009W-AYHL009W-A AIM44Q99299 758 aa3.51□□□□□ -1.85
YHL009W-AYHL009W-A SFL1P20134 766 aa3.5□□□□□ -1.85
YHL009W-AYHL009W-A TIM23P32897 222 aa3.5□□□□□ -1.85
YHL009W-AYHL009W-A ATO2P32907 282 aa3.5□□□□□ -1.85
YHL009W-AYHL009W-A LOT5P34234 306 aa3.5□□□□□ -1.85
YHL009W-AYHL009W-A DHR2P36009 735 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
YHL009W-AYHL009W-A CFD1P40558 293 aa3.5□□□□□ -1.85
YHL009W-AYHL009W-A YPL071CQ02864 156 aa3.5□□□□□ -1.85
YHL009W-AYHL009W-A PPN1Q04119 674 aa3.5□□□□□ -1.85
YHL009W-AYHL009W-A YPS7Q06325 596 aa3.5□□□□□ -1.85
YHL009W-AYHL009W-A BRN1P38170 754 aa3.49□□□□□ -1.85
YHL009W-AYHL009W-A CRG1P38892 291 aaRIP-Chip data3.49□□□□□ -1.85not detected
YHL009W-AYHL009W-A YIL092WP40497 633 aa3.49□□□□□ -1.85
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