RNA–Protein interactions for RNA: YGR058W

PEF1, Transcript of Penta-EF-hand protein, yeast

Gene PEF1, Length 1,008 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PEF1	YGR058W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PEF1	YGR058W	TPK2	P06245	380 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PEF1	YGR058W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PEF1	YGR058W	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PEF1	YGR058W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PEF1	YGR058W	HXT7	P39004	570 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PEF1	YGR058W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PEF1	YGR058W	SPO1	P53541	631 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PEF1	YGR058W	ECM9	Q02202	377 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PEF1	YGR058W	HOF1	Q05080	669 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PEF1	YGR058W	ERG11	P10614	530 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PEF1	YGR058W	STE4	P18851	423 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PEF1	YGR058W	SEC65	P29478	273 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PEF1	YGR058W	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PEF1	YGR058W	TMN3	P40071	706 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PEF1	YGR058W	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PEF1	YGR058W	REV3	P14284	1504 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PEF1	YGR058W	ATG2	P53855	1592 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	PRE4	P30657	266 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	OAF3	P36023	863 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	DUN1	P39009	513 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	IES1	P43579	692 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	YJR142W	P47173	342 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	TIM50	Q02776	476 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	RIM13	Q03792	727 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	PPN1	Q04119	674 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	HFD1	Q04458	532 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	ULA1	Q12059	462 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	PEP1	P32319	1579 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	TUP1	P16649	713 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	FAT1	P38225	669 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.7	□□□□□ -1.66	not detected
PEF1	YGR058W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	TAF4	P50105	388 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	FDC1	Q03034	503 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	TRS23	Q03784	219 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	YHM2	Q04013	314 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	YAP7	Q08182	245 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	SIN3	P22579	1536 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	NUP1	P20676	1076 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	FTR1	P40088	404 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	TAX4	P47030	604 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	GPG1	P53130	126 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	UME1	Q03010	460 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	HFI1	Q12060	488 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	NUP145	P49687	1317 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	MRPL7	P36519	292 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	CDS1	P38221	457 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	YGL117W	P53133	265 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	ARG7	Q04728	441 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	PPE1	P38796	400 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	PRM2	P40534	656 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	VID28	P40547	921 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	PMT3	P47190	753 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	NSE5	Q03718	556 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	SEG1	Q04279	960 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	APM4	Q99186	491 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	CDC26	P14724	124 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	MTC7	P32633	139 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	YIP4	P53093	235 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	CPR8	P53728	308 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	HLR1	Q04429	423 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	SSK2	P53599	1579 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	TAF2	P23255	1407 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PEF1	YGR058W	AAD3	P25612	363 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PEF1	YGR058W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PEF1	YGR058W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PEF1	YGR058W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PEF1	YGR058W	ICT1	Q12385	394 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PEF1	YGR058W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PEF1	YGR058W	TMT1	P32643	299 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PEF1	YGR058W	DID4	P36108	232 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PEF1	YGR058W	EHT1	P38295	451 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PEF1	YGR058W	YHR033W	P38690	423 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PEF1	YGR058W	RIM4	P38741	713 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PEF1	YGR058W	THI6	P41835	540 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PEF1	YGR058W	PIP2	P52960	996 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PEF1	YGR058W	MFM1	Q02783	413 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PEF1	YGR058W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PEF1	YGR058W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PEF1	YGR058W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.63	□□□□□ -1.67	not detected
PEF1	YGR058W	MBR1	P23493	339 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PEF1	YGR058W	HOT13	P36078	116 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PEF1	YGR058W	XBP1	P40489	647 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PEF1	YGR058W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PEF1	YGR058W	ZPS1	Q12512	249 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PEF1	YGR058W	ESP1	Q03018	1630 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PEF1	YGR058W	CNE1	P27825	502 aa		4.62	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.5 ms