RNA–Protein interactions for RNA: YER104W

RTT105, Transcript of Protein with a role in regulation of Ty1 transposition, yeastyeast

Gene RTT105, Length 627 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTT105YER104W FOB1O13329 566 aa3.51□□□□□ -1.85
RTT105YER104W GLN4P13188 809 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RTT105YER104W YCL049CP25577 312 aa3.51□□□□□ -1.85
RTT105YER104W DGR2P32330 852 aa3.51□□□□□ -1.85
RTT105YER104W MF(ALPHA)2P32435 120 aa3.51□□□□□ -1.85
RTT105YER104W STE14P32584 239 aa3.51□□□□□ -1.85
RTT105YER104W APL2P36000 726 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
RTT105YER104W AKL1P38080 1108 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RTT105YER104W APM3P38153 483 aa3.51□□□□□ -1.85
RTT105YER104W APN2P38207 520 aa3.51□□□□□ -1.85
RTT105YER104W SWD1P39706 426 aa3.51□□□□□ -1.85
RTT105YER104W NDE1P40215 560 aa3.51□□□□□ -1.85
RTT105YER104W ESL1P40456 1118 aa3.51□□□□□ -1.85
RTT105YER104W SDP1P40479 209 aa3.51□□□□□ -1.85
RTT105YER104W SMK1P41808 388 aa3.51□□□□□ -1.85
RTT105YER104W SSY5P47002 699 aa3.51□□□□□ -1.85
RTT105YER104W YMR210WQ03649 449 aa3.51□□□□□ -1.85
RTT105YER104W SPC19Q03954 165 aa3.51□□□□□ -1.85
RTT105YER104W EIS1Q05050 843 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RTT105YER104W TRP4P07285 380 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RTT105YER104W MTF2P10849 440 aa3.5□□□□□ -1.85
RTT105YER104W RPT3P33298 428 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RTT105YER104W YHR078WP38799 552 aa3.5□□□□□ -1.85
RTT105YER104W YHR202WP38887 602 aa3.5□□□□□ -1.85
RTT105YER104W SCS2P40075 244 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RTT105YER104W SET2P46995 733 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RTT105YER104W MAD3P47074 515 aa3.5□□□□□ -1.85
RTT105YER104W CPR6P53691 371 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RTT105YER104W ARC35P53731 342 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RTT105YER104W ORC4P54791 529 aa3.5□□□□□ -1.85
RTT105YER104W MRPL13Q02204 264 aa3.5□□□□□ -1.85
RTT105YER104W VPS5Q92331 675 aa3.5□□□□□ -1.85
RTT105YER104W VAS1P07806 1104 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
RTT105YER104W YEL076C-AP0CX16 216 aa3.49□□□□□ -1.85
RTT105YER104W YLR464WP0CX17 216 aa3.49□□□□□ -1.85
RTT105YER104W ADH4P10127 382 aa3.49□□□□□ -1.85
RTT105YER104W IMG2P25642 146 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
RTT105YER104W SLC1P33333 303 aa3.49□□□□□ -1.85
RTT105YER104W YLF2P38746 405 aa3.49□□□□□ -1.85
RTT105YER104W SAK1P38990 1142 aa3.49□□□□□ -1.85
RTT105YER104W DUN1P39009 513 aa3.49□□□□□ -1.85
RTT105YER104W VPS8P39702 1274 aa3.49□□□□□ -1.85
RTT105YER104W SPC72P39723 622 aa3.49□□□□□ -1.85
RTT105YER104W YEL076CP39971 216 aa3.49□□□□□ -1.85
RTT105YER104W NOP16P40007 231 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
RTT105YER104W GID8P40208 455 aa3.49□□□□□ -1.85
RTT105YER104W MTR3P48240 250 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
RTT105YER104W GLO1P50107 326 aa3.49□□□□□ -1.85
RTT105YER104W IMO32P53219 342 aa3.49□□□□□ -1.85
RTT105YER104W LEE1Q02799 301 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
RTT105YER104W PEX19Q07418 342 aa3.49□□□□□ -1.85
RTT105YER104W SDH5Q08230 162 aa3.49□□□□□ -1.85
RTT105YER104W PHO5P00635 467 aa3.48□□□□□ -1.85
RTT105YER104W MRP7P12687 371 aa3.48□□□□□ -1.85
RTT105YER104W CBP3P21560 335 aa3.48□□□□□ -1.85
RTT105YER104W BLI1P35727 113 aa3.48□□□□□ -1.85
RTT105YER104W STT3P39007 718 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
RTT105YER104W PZF1P39933 429 aa3.48□□□□□ -1.85
RTT105YER104W FAF1P40546 346 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
RTT105YER104W IMA5P40884 581 aa3.48□□□□□ -1.85
RTT105YER104W YBP2P53169 641 aa3.48□□□□□ -1.85
RTT105YER104W RNT1Q02555 471 aa3.48□□□□□ -1.85
RTT105YER104W NSE5Q03718 556 aa3.48□□□□□ -1.85
RTT105YER104W TRI1Q05024 226 aa3.48□□□□□ -1.85
RTT105YER104W IMH1Q06704 911 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
RTT105YER104W VHS3Q08438 674 aa3.48□□□□□ -1.85
RTT105YER104W SWM1Q12379 170 aa3.48□□□□□ -1.85
RTT105YER104W YNL162W-AQ3E7A8 72 aa3.48□□□□□ -1.85
RTT105YER104W LEU2P04173 364 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
RTT105YER104W NUC1P08466 329 aa3.47□□□□□ -1.85
RTT105YER104W MIS1P09440 975 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
RTT105YER104W NCP1P16603 691 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
RTT105YER104W SIR1P21691 654 aa3.47□□□□□ -1.85
RTT105YER104W UBC1P21734 215 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
RTT105YER104W MCM3P24279 971 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
RTT105YER104W PAH1P32567 862 aa3.47□□□□□ -1.85
RTT105YER104W PET127P32606 800 aa3.47□□□□□ -1.85
RTT105YER104W NPR3P38742 1146 aa3.47□□□□□ -1.85
RTT105YER104W PUG1P40100 303 aa3.47□□□□□ -1.85
RTT105YER104W VHR1P40522 640 aa3.47□□□□□ -1.85
RTT105YER104W MAD2P40958 196 aa3.47□□□□□ -1.85
RTT105YER104W SAP4P53036 818 aa3.47□□□□□ -1.85
RTT105YER104W MNT2P53059 558 aa3.47□□□□□ -1.85
RTT105YER104W PPN1Q04119 674 aa3.47□□□□□ -1.85
RTT105YER104W VID22Q05934 901 aa3.47□□□□□ -1.85
RTT105YER104W YPS7Q06325 596 aa3.47□□□□□ -1.85
RTT105YER104W STP4Q07351 490 aa3.47□□□□□ -1.85
RTT105YER104W RTK1Q12100 620 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
RTT105YER104W MSL5Q12186 476 aaKnown RBP RIP-Chip data3.47□□□□□ -1.85not detected
RTT105YER104W GPR1Q12361 961 aa3.47□□□□□ -1.85
RTT105YER104W DBP10Q12389 995 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
RTT105YER104W ENT1Q12518 454 aa3.47□□□□□ -1.85
RTT105YER104W SNF1P06782 633 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RTT105YER104W PYC1P11154 1178 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RTT105YER104W IME1P21190 360 aa3.46□□□□□ -1.86
RTT105YER104W SAN1P22470 610 aa3.46□□□□□ -1.86
RTT105YER104W CLB4P24871 460 aa3.46□□□□□ -1.86
RTT105YER104W SEC21P32074 935 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RTT105YER104W MRPL36P36531 177 aa3.46□□□□□ -1.86
RTT105YER104W APT2P36973 181 aa3.46□□□□□ -1.86
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