RNA–Protein interactions for RNA: YCL028W

RNQ1, Transcript of [PIN(+)] prion, yeast

Gene RNQ1, Length 1,218 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RNQ1	YCL028W	THI20	Q08224	551 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	NBP2	Q12163	236 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	APM4	Q99186	491 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	CDC8	P00572	216 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	YBR056W	P38081	501 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	PCA1	P38360	1216 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	LYS9	P38999	446 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	FMP10	P40098	244 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	CDC1	P40986	491 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	TAF1	P46677	1066 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	VTC4	P47075	721 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	YNL108C	P53929	270 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	HEH2	Q03281	663 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	RKM2	Q03942	479 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	CIR2	Q08822	631 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	NUR1	Q12066	484 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	MAS1	P10507	462 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	SFL1	P20134	766 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	MMS21	P38632	267 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	GUF1	P46943	645 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	THI7	Q05998	598 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	AHC1	Q12433	566 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	RAD27	P26793	382 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	MET4	P32389	672 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	YBR053C	P38235	358 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	YMR134W	P40207	237 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	FMP25	Q08023	583 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	THI21	Q08975	551 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	SAM3	Q08986	587 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	PGS1	P25578	521 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	MEI4	P29467	408 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	PEP7	P32609	515 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.64	□□□□□ -0.55	not detected
RNQ1	YCL028W	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	SIF2	P38262	535 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	MSG5	P38590	489 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	ERP2	P39704	215 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	TMA108	P40462	946 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	YIR016W	P40572	265 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	ATG36	P46983	293 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	VPS25	P47142	202 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	YPL062W	Q02781	134 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	MNL2	Q12205	849 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	RAD10	P06838	210 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	IDI1	P15496	288 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	SLY1	P22213	666 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	NFU1	P32860	256 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	ARG2	P40360	574 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	EAR1	Q03212	550 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	SPO71	Q03868	1245 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	HRD3	Q05787	833 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	YDR018C	Q12185	396 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.62	□□□□□ -0.55	not detected
RNQ1	YCL028W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	VHC1	P38329	1120 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	FLC2	P39719	783 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	PRK1	P40494	810 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	YNL320W	P42840	284 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	MIC19	P43594	170 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	NMD5	P46970	1048 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	BET4	Q00618	327 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	RGR1	P19263	1082 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	LTV1	P34078	463 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	FHL1	P39521	936 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	SAW1	P39735	261 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	RGD2	P43556	714 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	PEX31	P53203	462 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	INA17	Q02888	182 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	SND1	Q04007	877 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	ARP7	Q12406	477 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.6	□□□□□ -0.55	not detected
RNQ1	YCL028W	URK1	P27515	501 aa		11.6	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	RIM4	P38741	713 aa		11.6	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	MAF1	P41910	395 aa		11.6	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	ALY2	P47029	1046 aa		11.6	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	YJL045W	P47052	634 aa		11.6	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	AAD4	Q07747	329 aa		11.6	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	ACM1	Q08981	209 aa		11.6	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
RNQ1	YCL028W	SPO16	P17122	198 aa		11.59	□□□□□ -0.55

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