RNA–Protein interactions for RNA: YBL018C

POP8, Transcript of Subunit of both RNase MRP and nuclear RNase P, yeast

Gene POP8, Length 402 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
POP8	YBL018C	HMG2	P12684	1045 aa		5	□□□□□ -1.61
POP8	YBL018C	CTP1	P38152	299 aa		5	□□□□□ -1.61
POP8	YBL018C	UBS1	P38290	277 aa		5	□□□□□ -1.61
POP8	YBL018C	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
POP8	YBL018C	KHA1	P40309	873 aa		5	□□□□□ -1.61
POP8	YBL018C	SDS3	P40505	327 aa		5	□□□□□ -1.61
POP8	YBL018C	YDL183C	P48569	320 aa		5	□□□□□ -1.61
POP8	YBL018C	HOL1	P53389	586 aa		5	□□□□□ -1.61
POP8	YBL018C	TIM44	Q01852	431 aa		5	□□□□□ -1.61
POP8	YBL018C	TIM50	Q02776	476 aa		5	□□□□□ -1.61
POP8	YBL018C	YOL057W	Q08225	711 aa		5	□□□□□ -1.61
POP8	YBL018C	YOR378W	Q08902	515 aa		5	□□□□□ -1.61
POP8	YBL018C	NDC80	P40460	691 aa		4.99	□□□□□ -1.61
POP8	YBL018C	YJR008W	P47085	338 aa		4.99	□□□□□ -1.61
POP8	YBL018C	PEF1	P53238	335 aa		4.99	□□□□□ -1.61
POP8	YBL018C	ATG4	P53867	494 aa		4.99	□□□□□ -1.61
POP8	YBL018C	TMN2	Q04562	672 aa		4.99	□□□□□ -1.61
POP8	YBL018C	YCG1	Q06680	1035 aa		4.99	□□□□□ -1.61
POP8	YBL018C	IZH3	Q07959	543 aa		4.99	□□□□□ -1.61
POP8	YBL018C	FUB1	P25659	250 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POP8	YBL018C	NTH1	P32356	751 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POP8	YBL018C	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
POP8	YBL018C	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
POP8	YBL018C	TMN3	P40071	706 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POP8	YBL018C	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
POP8	YBL018C	MNT2	P53059	558 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POP8	YBL018C	YGR151C	P53287	111 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POP8	YBL018C	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
POP8	YBL018C	YDL086W	Q07505	273 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POP8	YBL018C	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
POP8	YBL018C	VPS5	Q92331	675 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POP8	YBL018C	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
POP8	YBL018C	NIC96	P34077	839 aa		4.97	□□□□□ -1.61
POP8	YBL018C	EHT1	P38295	451 aa		4.97	□□□□□ -1.61
POP8	YBL018C	STL1	P39932	569 aa		4.97	□□□□□ -1.61
POP8	YBL018C	ARG2	P40360	574 aa		4.97	□□□□□ -1.61
POP8	YBL018C	YIL092W	P40497	633 aa		4.97	□□□□□ -1.61
POP8	YBL018C	GND2	P53319	492 aa		4.97	□□□□□ -1.61
POP8	YBL018C	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
POP8	YBL018C	ABF1	P14164	731 aa		4.96	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	MTH1	P35198	433 aa		4.96	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	MAD2	P40958	196 aa		4.96	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	SNF12	P53628	566 aa		4.96	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	AIM41	Q12032	185 aa		4.96	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	PSF3	Q12146	194 aa		4.96	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	TAF3	Q12297	353 aa		4.96	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	PHO3	P24031	467 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	ELF1	P36053	145 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	BDH2	P39713	417 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	MET14	Q02196	202 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	NUR1	Q12066	484 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	RKI1	Q12189	258 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	ATP4	P05626	244 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	HOP1	P20050	605 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	KCC4	P25389	1037 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	CWH43	P25618	953 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	MRPL7	P36519	292 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	YJL206C	P39529	758 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	CTR1	P49573	406 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	UBA2	P52488	636 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	NMA2	P53204	395 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	YNR071C	P53757	342 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	DIN7	Q12086	430 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	URA3	P03962	267 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	ARG1	P22768	420 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	GLG1	P36143	616 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	LRO1	P40345	661 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	ATG36	P46983	293 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	TAH11	P47112	604 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	DIP5	P53388	608 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	ARR3	Q06598	404 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	GAL1	P04385	528 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	KIN3	P22209	435 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	GMH1	P36125	273 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	UFO1	Q04511	668 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	IRC10	Q08118	586 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	LAM4	P38800	1345 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	TGL1	P34163	548 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	APL3	P38065	1025 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	PPE1	P38796	400 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	SAW1	P39735	261 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	YEL025C	P39991	1188 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	ASK10	P48361	1146 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	PIP2	P52960	996 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	MLC2	Q06580	163 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POP8	YBL018C	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
POP8	YBL018C	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62

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