RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597304.5

ZNF558-205, Transcript of zinc finger protein 558, humanhuman

TSL 5

Gene ZNF558, Length 2,612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558-205ENST00000597304 CASQ1P31415 396 aa14.52□□□□□ -0.08
ZNF558-205ENST00000597304 SYKP43405 635 aa14.52□□□□□ -0.08
ZNF558-205ENST00000597304 MUM1L1Q5H9M0 696 aa14.52□□□□□ -0.08
ZNF558-205ENST00000597304 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa14.52□□□□□ -0.08
ZNF558-205ENST00000597304 ARHGAP23Q9P227 1491 aa14.52□□□□□ -0.08
ZNF558-205ENST00000597304 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 TICAM2Q86XR7 235 aa14.52□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 SMARCE1Q969G3 411 aa14.52□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 NEUROD6Q96NK8 337 aa14.52□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 MYO1BO43795 1136 aa14.51□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 ST5P78524 1137 aa14.51□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 GOLGA8FQ08AF8 430 aa14.51□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa14.51□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa14.51□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 EPC1Q9H2F5 836 aa14.51□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 ARFGAP3Q9NP61 516 aa14.51□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 GOLGA8BA8MQT2 603 aa14.51□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 KIF28PB7ZC32 967 aa14.51□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 CPLX1O14810 134 aa14.51□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 PPP2R3AQ06190 1150 aa14.51□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 OLFM4Q6UX06 510 aa14.51□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa14.51□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa14.5□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 KCNA6P17658 529 aa14.5□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 GNG11P61952 73 aa14.5□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 MAP3K9P80192 1104 aa14.5□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 TTLL5Q6EMB2 1281 aa14.5□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 ZNF790Q6PG37 636 aa14.5□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 KRBA2Q6ZNG9 492 aa14.5□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 TMEM139Q8IV31 216 aa14.5□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 CCDC34Q96HJ3 373 aa14.5□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 MRFAP1Q9Y605 127 aa14.5□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 TMEM232C9JQI7 657 aa14.5□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 SLC39A6Q13433 755 aa14.5□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 SLC39A14Q15043 492 aa14.5□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 GJB4Q9NTQ9 266 aa14.49□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 LMTK3Q96Q04 1460 aa14.49□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 A0A087WZG4 1122 aa14.49□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 PNOCQ13519 176 aa14.49□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 JMYQ8N9B5 988 aa14.49□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 WDR24Q96S15 920 aa14.49□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 HPSEQ9Y251 543 aa14.49□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 SPEF2Q9C093 1822 aa14.49□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa14.49□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 M0R2C6 588 aa14.48□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 PRC1O43663 620 aa14.48□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 ANKRD24Q8TF21 1146 aa14.48□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 RABGGTAQ92696 567 aa14.48□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 AK7Q96M32 723 aa14.48□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 FANCLQ9NW38 375 aa14.48□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 HPS5Q9UPZ3 1129 aa14.48□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 PTPN21Q16825 1174 aa14.48□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 GOLGA1Q92805 767 aa14.48□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 PARD6BQ9BYG5 372 aa14.48□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 NWD2Q9ULI1 1742 aa14.48□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 SLIT3O75094 1523 aa14.48□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa14.47□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 STX10O60499 249 aa14.47□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 PPP6R2O75170 966 aa14.47□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 ZSCAN26Q16670 478 aa14.47□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa14.47□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 LMBR1LQ6UX01 489 aa14.47□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa14.47□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 TRIM34Q9BYJ4 488 aa14.47□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 C4AP0C0L4 1744 aa14.47□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 C4BP0C0L5 1744 aa14.47□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa14.47□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 HAND2P61296 217 aa14.47□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 TIMM10P62072 90 aa14.47□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 SHC4Q6S5L8 630 aa14.47□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 PDILTQ8N807 584 aa14.47□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 FUT8Q9BYC5 575 aa14.47□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 C19orf44Q9H6X5 657 aa14.47□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 GPR108Q9NPR9 543 aa14.47□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 INTS13Q9NVM9 706 aa14.47□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 KIFC2Q96AC6 838 aa14.46□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa14.46□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 ATG9AQ7Z3C6 839 aa14.46□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 EXOC4Q96A65 974 aa14.46□□□□□ -0.09
ZNF558-205ENST00000597304 CCDC151A5D8V7 595 aa14.45□□□□□ -0.1
ZNF558-205ENST00000597304 TXLNAP40222 546 aa14.45□□□□□ -0.1
ZNF558-205ENST00000597304 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 123.7 ms