RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575194.5

SPNS3-204, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SPNS3, Length 1,721 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-204ENST00000575194 KIF3AQ9Y496 699 aa22.09■■□□□ 1.13
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SPNS3-204ENST00000575194 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS3-204ENST00000575194 CRY2Q49AN0 593 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS3-204ENST00000575194 SGIP1Q9BQI5 828 aa22.09■■□□□ 1.13
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SPNS3-204ENST00000575194 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.12
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SPNS3-204ENST00000575194 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa22.06■■□□□ 1.12
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SPNS3-204ENST00000575194 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
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SPNS3-204ENST00000575194 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
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SPNS3-204ENST00000575194 COL4A1P02462 1669 aa22.04■■□□□ 1.12
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SPNS3-204ENST00000575194 UBE2HP62256 183 aa22.03■■□□□ 1.12
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SPNS3-204ENST00000575194 CHD4Q14839 1912 aa22■■□□□ 1.11
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SPNS3-204ENST00000575194 MBD4O95243 580 aa22■■□□□ 1.11
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SPNS3-204ENST00000575194 DENND2AQ9ULE3 1009 aa21.99■■□□□ 1.11
SPNS3-204ENST00000575194 MYH13Q9UKX3 1938 aa21.99■■□□□ 1.11
SPNS3-204ENST00000575194 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SPNS3-204ENST00000575194 LRSAM1Q6UWE0 723 aa21.98■■□□□ 1.11
SPNS3-204ENST00000575194 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
SPNS3-204ENST00000575194 CRAMP1Q96RY5 1269 aa21.98■■□□□ 1.11
SPNS3-204ENST00000575194 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
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