RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418674.1

PTPRC-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 462 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-207ENST00000418674 FAM20CQ8IXL6 584 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-207ENST00000418674 CCDC74AQ96AQ1 378 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-207ENST00000418674 CSRNP1Q96S65 589 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-207ENST00000418674 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-207ENST00000418674 C7orf69Q9H7B7 122 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-207ENST00000418674 DCTN4Q9UJW0 460 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-207ENST00000418674 IGHA2P01877 340 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-207ENST00000418674 CYP11A1P05108 521 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-207ENST00000418674 NFIAQ12857 509 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-207ENST00000418674 ZNF423Q2M1K9 1284 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-207ENST00000418674 CCDC27Q2M243 656 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-207ENST00000418674 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-207ENST00000418674 BEND4Q6ZU67 534 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-207ENST00000418674 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-207ENST00000418674 CLEC10AQ8IUN9 316 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-207ENST00000418674 TRIM42Q8IWZ5 723 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-207ENST00000418674 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-207ENST00000418674 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
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PTPRC-207ENST00000418674 SUGCTQ9HAC7 445 aa5.03□□□□□ -1.6
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PTPRC-207ENST00000418674 TRAK1Q9UPV9 953 aa5.03□□□□□ -1.6
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PTPRC-207ENST00000418674 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-207ENST00000418674 B3GALT4O96024 378 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-207ENST00000418674 ITPKAP23677 461 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-207ENST00000418674 MAPK1P28482 360 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-207ENST00000418674 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-207ENST00000418674 POU4F3Q15319 338 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-207ENST00000418674 RNF43Q68DV7 783 aa5.02□□□□□ -1.61
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PTPRC-207ENST00000418674 TMC7Q7Z402 723 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-207ENST00000418674 DBNDD2Q9BQY9 259 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-207ENST00000418674 ZNF576Q9H609 170 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-207ENST00000418674 TIAF1O95411 115 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-207ENST00000418674 DLGAP3O95886 979 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-207ENST00000418674 MAOBP27338 520 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-207ENST00000418674 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-207ENST00000418674 RXRBP28702 533 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-207ENST00000418674 SGO2Q562F6 1265 aa5.01□□□□□ -1.61
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PTPRC-207ENST00000418674 NRSN2Q9GZP1 204 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-207ENST00000418674 ABCB6Q9NP58 842 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-207ENST00000418674 PCMTD2Q9NV79 361 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-207ENST00000418674 NLRP2Q9NX02 1062 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-207ENST00000418674 PPP4R2Q9NY27 417 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-207ENST00000418674 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-207ENST00000418674 TGFB1P01137 390 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-207ENST00000418674 SSTR4P31391 388 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-207ENST00000418674 GRIK1P39086 918 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-207ENST00000418674 USP11P51784 963 aa5□□□□□ -1.61
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PTPRC-207ENST00000418674 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
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PTPRC-207ENST00000418674 GIMAP7Q8NHV1 300 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-207ENST00000418674 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PTPRC-207ENST00000418674 YIPF2Q9BWQ6 316 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-207ENST00000418674 COBLO75128 1261 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-207ENST00000418674 ADH5P11766 374 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-207ENST00000418674 DRD2P14416 443 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-207ENST00000418674 PLCB3Q01970 1234 aa4.99□□□□□ -1.61
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PTPRC-207ENST00000418674 DTHD1Q6ZMT9 781 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-207ENST00000418674 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
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PTPRC-207ENST00000418674 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.99□□□□□ -1.61
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PTPRC-207ENST00000418674 RAD18Q9NS91 495 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-207ENST00000418674 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-207ENST00000418674 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-207ENST00000418674 TREHO43280 583 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-207ENST00000418674 CTSBP07858 339 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-207ENST00000418674 CD97P48960 835 aa4.98□□□□□ -1.61
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PTPRC-207ENST00000418674 PDE3AQ14432 1141 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-207ENST00000418674 DSC3Q14574 896 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-207ENST00000418674 NFKBIBQ15653 356 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-207ENST00000418674 AKAP4Q5JQC9 854 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-207ENST00000418674 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-207ENST00000418674 PAOXQ6QHF9 649 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-207ENST00000418674 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
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PTPRC-207ENST00000418674 FBLIM1Q8WUP2 373 aa4.98□□□□□ -1.61
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PTPRC-207ENST00000418674 ECEL1O95672 775 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-207ENST00000418674 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-207ENST00000418674 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-207ENST00000418674 FCGRTP55899 365 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-207ENST00000418674 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-207ENST00000418674 CDPF1Q6NVV7 123 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-207ENST00000418674 PI16Q6UXB8 463 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-207ENST00000418674 DYMQ7RTS9 669 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-207ENST00000418674 BCO2Q9BYV7 579 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-207ENST00000418674 ATG3Q9NT62 314 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-207ENST00000418674 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-207ENST00000418674 AP4E1Q9UPM8 1137 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-207ENST00000418674 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 RAB6AP20340 208 aa4.96□□□□□ -1.62
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