RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215941.8

ANKRD54-201, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD54, Length 2,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-201ENST00000215941 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa26.44■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa26.43■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 NCAPHQ15003 741 aa26.43■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa26.43■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP26.43■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa26.43■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 C8orf76Q96K31 380 aa26.43■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa26.43■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 TNS2Q63HR2 1409 aa26.42■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa26.42■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF202O95125 648 aa26.42■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 FOSBP53539 338 aa26.42■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 TMOD3Q9NYL9 352 aa26.42■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa26.42■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 A1BGP04217 495 aa26.41■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 MYSM1Q5VVJ2 828 aa26.41■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa26.41■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 FHOD1Q9Y613 1164 aa26.41■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 A0A087WWV3 80 aa26.41■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 CASP7P55210 303 aa26.41■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 A0A087WZG4 1122 aa26.4■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 GOLIM4O00461 696 aa26.4■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 CLCN6P51797 869 aa26.4■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 FANCCQ00597 558 aa26.4■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 GUCY1B3Q02153 619 aa26.4■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa26.4■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 WDR19Q8NEZ3 1342 aa26.4■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 CHGBP05060 677 aa26.4■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 TMX1Q9H3N1 280 aa26.4■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 CLIC4Q9Y696 253 aa26.4■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 TTLL7Q6ZT98 887 aa26.39■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 HOMER1Q86YM7 354 aa26.39■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 UBXN4Q92575 508 aa26.39■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 TUBE1Q9UJT0 475 aa26.39■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 MAST3O60307 1309 aa26.39■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP26.39■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 IL15P40933 162 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa26.39■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 EFCAB8A8MWE9 144 aa26.38■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 ANO1Q5XXA6 986 aa26.38■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 DNAI1Q9UI46 699 aa26.38■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 ZSCAN12O43309 604 aa26.37■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 CYP2C19P33261 490 aa26.37■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 TMCO3Q6UWJ1 677 aa26.37■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 NUP188Q5SRE5 1749 aa26.37■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa26.37■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa26.36■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 JMYQ8N9B5 988 aa26.36■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 PFKFB1P16118 471 aa26.36■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 ATG9AQ7Z3C6 839 aa26.36■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 MYL5Q02045 173 aa26.35■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 SLC39A14Q15043 492 aa26.35■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 TEX35Q5T0J7 233 aa26.35■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 TRIM65Q6PJ69 517 aa26.35■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 MNS1Q8NEH6 495 aa26.35■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 FBXW7Q969H0 707 aa26.35■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 MPHOSPH8Q99549 860 aa26.35■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 PPP6R2O75170 966 aa26.34■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 CCDC158Q5M9N0 1113 aa26.34■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 LMBR1LQ6UX01 489 aa26.34■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 ATG3Q9NT62 314 aa26.34■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 DISP2A7MBM2 1401 aa26.34■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 NWD2Q9ULI1 1742 aa26.34■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 H7C1W4 665 aa26.33■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 TADA3O75528 432 aa26.33■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 UBASH3AP57075 661 aa26.33■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 FOXO4P98177 505 aa26.33■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 PIGBQ92521 554 aa26.33■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 NEUROD6Q96NK8 337 aa26.33■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 HSD3B7Q9H2F3 369 aa26.33■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 ZBTB3Q9H5J0 574 aa26.33■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 HPSEQ9Y251 543 aa26.33■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 ARHGAP6O43182 974 aa26.33■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 CIAO1O76071 339 aa26.33■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 VSTM4Q8IW00 320 aa26.33■■□□□ 1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 C4AP0C0L4 1744 aa26.33■■□□□ 1.8
ANKRD54-201ENST00000215941 C4BP0C0L5 1744 aa26.33■■□□□ 1.8
ANKRD54-201ENST00000215941 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
ANKRD54-201ENST00000215941 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
ANKRD54-201ENST00000215941 ASAP1Q9ULH1 1129 aa26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms