RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019749.3

Hoxd8-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd8, Length 2,634 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Trim30aP15533 496 aa30.48■■■□□ 2.47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 CerkQ8K4Q7 531 aa30.48■■■□□ 2.47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Bin1O08539 588 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cdkn1cP49919 348 aa30.47■■■□□ 2.47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 CebpaP53566 359 aa30.47■■■□□ 2.47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Slu7Q8BHJ9 585 aa30.47■■■□□ 2.47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Eaf2Q91ZD6 262 aa30.47■■■□□ 2.47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mast3Q3U214 1321 aa30.47■■■□□ 2.47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Prr5lA2AVJ5 370 aa30.47■■■□□ 2.47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 VeztQ3ZK22 780 aa30.47■■■□□ 2.47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rapgef4Q9EQZ6 1011 aa30.47■■■□□ 2.47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 IcoslgQ9JHJ8 322 aa30.47■■■□□ 2.47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ankrd31A0A140LI88 1765 aa30.47■■■□□ 2.47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fkbp1aP26883 108 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cep63Q3UPP8 700 aa30.46■■■□□ 2.47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Prkag3Q8BGM7 489 aa30.46■■■□□ 2.47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ces1dQ8VCT4 565 aa30.46■■■□□ 2.47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zeb2Q9R0G7 1215 aa30.46■■■□□ 2.47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zbtb21E9Q444 1094 aa30.46■■■□□ 2.47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Bola3Q8CEI1 110 aa30.46■■■□□ 2.47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pram1Q6BCL1 675 aa30.45■■■□□ 2.47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Plekho1Q9JIY0 408 aa30.45■■■□□ 2.47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mroh6V9GX81 722 aa30.45■■■□□ 2.47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 CpdO89001 1377 aa30.45■■■□□ 2.47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lrrc8aQ80WG5 810 aa30.45■■■□□ 2.46
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Washc4Q3UMB9 1173 aa30.44■■■□□ 2.46
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zfp202Q8C879 641 aa30.44■■■□□ 2.46
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nop2Q922K7 793 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lrp6O88572 1613 aa30.44■■■□□ 2.46
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm43638A0A0J9YU36 694 aa30.44■■■□□ 2.46
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Exoc5Q3TPX4 708 aa30.44■■■□□ 2.46
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zkscan4Q5SZT6 480 aa30.44■■■□□ 2.46
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Susd4Q8BH32 490 aa30.44■■■□□ 2.46
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Luzp1Q8R4U7 1068 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dnm1P39053 867 aa30.43■■■□□ 2.46
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pfkfb1P70266 471 aa30.43■■■□□ 2.46
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Acot9Q9R0X4 439 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rgs12Q8CGE9 1381 aa30.43■■■□□ 2.46
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cplx1P63040 134 aa30.43■■■□□ 2.46
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ehd2Q8BH64 543 aa30.43■■■□□ 2.46
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Med23Q80YQ2 1367 aa30.42■■■□□ 2.46
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm4340L7N2C4 268 aa30.42■■■□□ 2.46
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dctn1O08788 1281 aa30.42■■■□□ 2.46
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ube2oQ6ZPJ3 1288 aa30.42■■■□□ 2.46
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krt84Q99M73 603 aa30.42■■■□□ 2.46
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Naaladl2A0A0N4SUJ3 795 aa30.41■■■□□ 2.46
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm45140A0A0N4SUM8 220 aa30.41■■■□□ 2.46
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ranbp6Q8BIV3 1105 aa30.41■■■□□ 2.46
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Casp12O08736 419 aa30.41■■■□□ 2.46
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 NapbP28663 298 aa30.41■■■□□ 2.46
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Slf2Q6P9P0 1278 aa30.41■■■□□ 2.46
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Myh2G3UW82 1942 aa30.4■■■□□ 2.46
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Snrpa1P57784 255 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Epha2Q03145 977 aa30.4■■■□□ 2.46
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Esco1Q69Z69 843 aa30.4■■■□□ 2.46
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Speer4dL7N216 212 aa30.39■■■□□ 2.46
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Agtpbp1Q641K1 1218 aa30.39■■■□□ 2.46
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kiaa0753Q6A000 959 aa30.39■■■□□ 2.46
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Abtb2Q7TQI7 1024 aa30.39■■■□□ 2.46
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Miga2Q8BK03 593 aa30.39■■■□□ 2.46
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Stxbp4Q9WV89 557 aa30.39■■■□□ 2.46
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ufl1Q8CCJ3 793 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.45
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rbm43Q99J64 343 aa30.39■■■□□ 2.45
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cdkl5Q3UTQ8 938 aa30.38■■■□□ 2.45
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nme8Q715T0 586 aa30.38■■■□□ 2.45
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 9230110C19RikQ8CC70 267 aa30.38■■■□□ 2.45
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krt24A1L317 512 aa30.38■■■□□ 2.45
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sass6Q80UK7 654 aa30.38■■■□□ 2.45
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 4931408C20RikE9PWP9 1381 aa30.37■■■□□ 2.45
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lrp5Q91VN0 1614 aa30.37■■■□□ 2.45
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dnajc2P54103 621 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Trim34aQ99PP6 485 aa30.37■■■□□ 2.45
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mrps25Q9D125 171 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 CrcpO35427 148 aa30.37■■■□□ 2.45
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cplx2P84086 134 aa30.37■■■□□ 2.45
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccdc47Q9D024 483 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Large1Q9Z1M7 756 aa30.37■■■□□ 2.45
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tulp1Q9Z273 543 aa30.37■■■□□ 2.45
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccdc174Q3U155 467 aa30.36■■■□□ 2.45
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ints4Q8CIM8 964 aa30.36■■■□□ 2.45
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sirt2Q8VDQ8 389 aa30.36■■■□□ 2.45
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ube3cQ80U95 1083 aa30.36■■■□□ 2.45
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rec8Q8C5S7 591 aa30.36■■■□□ 2.45
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fbxo3Q9DC63 480 aa30.36■■■□□ 2.45
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Xpo4Q9ESJ0 1151 aa30.36■■■□□ 2.45
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pcdhb14Q6PB90 796 aa30.35■■■□□ 2.45
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Suclg2Q9Z2I8 433 aa30.35■■■□□ 2.45
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zscan29E9Q5B4 869 aa30.35■■■□□ 2.45
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zbtb7aO88939 569 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gas2l3Q3UWW6 683 aa30.35■■■□□ 2.45
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kiaa1524Q8BWY9 907 aa30.34■■■□□ 2.45
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nbr1P97432 988 aa30.33■■■□□ 2.45
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pold4Q9CWP8 107 aa30.33■■■□□ 2.45
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Brwd3A2AHJ4 1799 aa30.33■■■□□ 2.45
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gpr108Q91WD0 569 aa30.33■■■□□ 2.45
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Popdc2Q9ES82 367 aa30.33■■■□□ 2.45
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cyp2c23E9Q5K4 494 aa30.32■■■□□ 2.44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ap5z1Q3U829 807 aa30.32■■■□□ 2.44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 TfrcQ62351 763 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Vps37dQ810I0 261 aa30.32■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.9 ms