RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 SGPP2Q8IWX5 399 aa12.92□□□□□ -0.34
HERC3-211ENST00000513325 OR10R2Q8NGX6 335 aa12.92□□□□□ -0.34
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HERC3-211ENST00000513325 COA4Q9NYJ1 87 aa12.92□□□□□ -0.34
HERC3-211ENST00000513325 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
HERC3-211ENST00000513325 ADAM30Q9UKF2 790 aa12.92□□□□□ -0.34
HERC3-211ENST00000513325 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
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HERC3-211ENST00000513325 TRBV12-3P01733 135 aa12.91□□□□□ -0.34
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HERC3-211ENST00000513325 ZNF343Q6P1L6 599 aa12.91□□□□□ -0.34
HERC3-211ENST00000513325 PHB2Q99623 299 aa12.91□□□□□ -0.34
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HERC3-211ENST00000513325 MSGN1A6NI15 193 aa12.9□□□□□ -0.34
HERC3-211ENST00000513325 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
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HERC3-211ENST00000513325 USMG5Q96IX5 58 aa12.9□□□□□ -0.34
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HERC3-211ENST00000513325 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
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HERC3-211ENST00000513325 A0A0B4J203 849 aa12.89□□□□□ -0.35
HERC3-211ENST00000513325 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa12.89□□□□□ -0.35
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HERC3-211ENST00000513325 TEX45Q8NA69 505 aa12.89□□□□□ -0.35
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HERC3-211ENST00000513325 RAB6AP20340 208 aa12.88□□□□□ -0.35
HERC3-211ENST00000513325 TALDO1P37837 337 aa12.88□□□□□ -0.35
HERC3-211ENST00000513325 TATDN3Q17R31 274 aa12.88□□□□□ -0.35
HERC3-211ENST00000513325 RPEL1Q2QD12 228 aa12.88□□□□□ -0.35
HERC3-211ENST00000513325 IDO2Q6ZQW0 420 aa12.88□□□□□ -0.35
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HERC3-211ENST00000513325 ADTRPQ96IZ2 230 aa12.88□□□□□ -0.35
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HERC3-211ENST00000513325 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
HERC3-211ENST00000513325 HAGHQ16775 308 aa12.87□□□□□ -0.35
HERC3-211ENST00000513325 Q6ZS49 121 aa12.87□□□□□ -0.35
HERC3-211ENST00000513325 ZNF367Q7RTV3 350 aa12.87□□□□□ -0.35
HERC3-211ENST00000513325 ACOT12Q8WYK0 555 aa12.87□□□□□ -0.35
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HERC3-211ENST00000513325 ISOC1Q96CN7 298 aa12.87□□□□□ -0.35
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HERC3-211ENST00000513325 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
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HERC3-211ENST00000513325 J3QRK9 145 aa12.86□□□□□ -0.35
HERC3-211ENST00000513325 RAB3BP20337 219 aa12.86□□□□□ -0.35
HERC3-211ENST00000513325 MYL9P24844 172 aa12.86□□□□□ -0.35
HERC3-211ENST00000513325 RHOGP84095 191 aa12.86□□□□□ -0.35
HERC3-211ENST00000513325 LCN12Q6JVE5 192 aa12.86□□□□□ -0.35
HERC3-211ENST00000513325 GTSCR1Q86UQ5 136 aa12.86□□□□□ -0.35
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HERC3-211ENST00000513325 ATG5Q9H1Y0 275 aa12.86□□□□□ -0.35
HERC3-211ENST00000513325 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
HERC3-211ENST00000513325 AKIP1Q9NQ31 210 aa12.86□□□□□ -0.35
HERC3-211ENST00000513325 NDUFB11Q9NX14 153 aa12.86□□□□□ -0.35
HERC3-211ENST00000513325 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa12.86□□□□□ -0.35
HERC3-211ENST00000513325 LCE6AA0A183 80 aa12.85□□□□□ -0.35
HERC3-211ENST00000513325 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa12.85□□□□□ -0.35
HERC3-211ENST00000513325 ERICH4A6NGS2 130 aa12.85□□□□□ -0.35
HERC3-211ENST00000513325 OR2A4O95047 310 aa12.85□□□□□ -0.35
HERC3-211ENST00000513325 ZNF45Q02386 682 aa12.85□□□□□ -0.35
HERC3-211ENST00000513325 NR2C2APQ86WQ0 139 aa12.85□□□□□ -0.35
HERC3-211ENST00000513325 CNBD2Q96M20 576 aa12.85□□□□□ -0.35
HERC3-211ENST00000513325 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa12.85□□□□□ -0.35
HERC3-211ENST00000513325 TUBA4BQ9H853 241 aa12.85□□□□□ -0.35
HERC3-211ENST00000513325 SMIM30A4D0T7 59 aa12.84□□□□□ -0.35
HERC3-211ENST00000513325 FAM223BA6NKX1 122 aa12.84□□□□□ -0.35
HERC3-211ENST00000513325 BMPR1BO00238 502 aa12.84□□□□□ -0.35
HERC3-211ENST00000513325 FCGR3BO75015 233 aa12.84□□□□□ -0.35
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