RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 RPEL1Q2QD12 228 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM177Q53S58 311 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 Q8N1Y9 231 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 CABLES2Q9BTV7 478 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 A0A0B4J203 849 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 MSGN1A6NI15 193 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 A8MZ25 164 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 GNB3P16520 340 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 MYL9P24844 172 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 GTSCR1Q86UQ5 136 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 TEX45Q8NA69 505 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 SNAPC3Q92966 411 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 TM2D3Q9BRN9 247 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 TUBA4BQ9H853 241 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 KCNK7Q9Y2U2 307 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 ACTL6BO94805 426 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 MAP2K4P45985 399 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 ARL6IP1Q15041 203 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 TNXAQ16473 311 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 LCN12Q6JVE5 192 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF343Q6P1L6 599 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 ISOC1Q96CN7 298 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 C19orf73Q9NVV2 129 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 PEMTQ9UBM1 199 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 ANKRD65E5RJM6 399 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 IFNA6P05013 189 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 APELAP0DMC3 54 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 RAB6AP20340 208 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 CRHBPP24387 322 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 UBE2KP61086 200 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 ACOT12Q8WYK0 555 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 MAFIPQ8WZ33 124 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 SPATA25Q9BR10 227 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 VCX3BQ9H321 246 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 IFITM5A6NNB3 132 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 CRYZL1O95825 349 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 OR9G9P0C7N8 305 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 PLA2G7Q13093 441 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 PRSS8Q16651 343 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 Q8N402 240 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 ATG5Q9H1Y0 275 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 BLOC1S6Q9UL45 172 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 RAB27BO00194 218 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 MFNGO00587 321 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 OR2A4O95047 310 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 RAB3BP20337 219 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 DUTP33316 252 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 ATP5G2Q06055 141 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 ZFAND6Q6FIF0 208 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF367Q7RTV3 350 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 AIREO43918 545 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 TUSC2O75896 110 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 CTXN2P0C2S0 81 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 OR10A3P58181 314 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 DEFA5Q01523 94 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 DYRK1AQ13627 763 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 IL34Q6ZMJ4 242 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 IDO2Q6ZQW0 420 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 NRG4Q8WWG1 115 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 SPIN2AQ99865 258 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM223BA6NKX1 122 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 J3QRK9 145 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC22A5O76082 557 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 CSN3P07498 182 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 Q6ZS49 121 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC25A42Q86VD7 318 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM223AQ8IWN6 122 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 MMD2Q8IY49 270 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 OR2K2Q8NGT1 345 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 DDB2Q92466 427 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 TRBV12-3P01733 135 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 CD36P16671 472 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 DTYMKP23919 212 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 HSPA13P48723 471 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 RHOGP84095 191 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 CDK10Q15131 360 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 HAGHQ16775 308 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 CDNFQ49AH0 187 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM209BQ5JX69 171 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF645Q8N7E2 425 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 C5orf30Q96GV9 206 aa14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms