RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540904.1

SNHG1-215, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, humanhuman

TSL 5

Gene SNHG1, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG1-215ENST00000540904 PLSCR3Q9NRY6 295 aa7.32□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 COMMD3Q9UBI1 195 aa7.32□□□□□ -1.24
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SNHG1-215ENST00000540904 H0YJW9 148 aa7.31□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 H7C2Y5 167 aa7.31□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 J3QRK9 145 aa7.31□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 M0R1X1 148 aa7.31□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 XRCC3O43542 346 aa7.31□□□□□ -1.24
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SNHG1-215ENST00000540904 CTXN2P0C2S0 81 aa7.31□□□□□ -1.24
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SNHG1-215ENST00000540904 SLC35E3Q7Z769 313 aa7.31□□□□□ -1.24
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SNHG1-215ENST00000540904 GVQW1Q8N7I0 195 aa7.31□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
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SNHG1-215ENST00000540904 LINC01548A6NM66 108 aa7.3□□□□□ -1.24
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SNHG1-215ENST00000540904 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
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SNHG1-215ENST00000540904 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa7.29□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 MZT2AQ6P582 158 aa7.29□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 NDUFA11Q86Y39 141 aa7.29□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 OR4X2Q8NGF9 303 aa7.29□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 CHPT1Q8WUD6 406 aa7.29□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 C5orf30Q96GV9 206 aa7.29□□□□□ -1.24
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SNHG1-215ENST00000540904 RRHO14718 337 aa7.28□□□□□ -1.24
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SNHG1-215ENST00000540904 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 ELK1P19419 428 aa7.28□□□□□ -1.24
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SNHG1-215ENST00000540904 SLC35B1P78383 322 aa7.28□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 CD83Q01151 205 aa7.28□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 LIN54Q6MZP7 749 aa7.28□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 PDPNQ86YL7 162 aa7.28□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 STPG2Q8N412 459 aa7.28□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 NPBQ8NG41 125 aa7.28□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 RAB2BQ8WUD1 216 aa7.28□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 SNAPC3Q92966 411 aa7.28□□□□□ -1.24
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