RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 ZNF221Q9UK13 617 aa16.56■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 OR5H14A6NHG9 310 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 CNTFRP26992 372 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 MMDQ15546 238 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 UBE2NLQ5JXB2 153 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 GPR107Q5VW38 600 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 SAMD12Q8N8I0 201 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 GINS4Q9BRT9 223 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 GAB2Q9UQC2 676 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 XRCC3O43542 346 aa16.54■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 PTHLHP12272 177 aa16.54■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 MC5RP33032 325 aa16.54■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 LINC00205P59089 165 aa16.54■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 NDUFA11Q86Y39 141 aa16.54■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 ZNF383Q8NA42 475 aa16.54■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 NPBQ8NG41 125 aa16.54■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 LINC00527Q9UJ94 153 aa16.54■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 CMYA5Q8N3K9 4069 aa16.54■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa16.54■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 CTXN2P0C2S0 81 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 CNIH2Q6PI25 160 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 CHPT1Q8WUD6 406 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 C5orf30Q96GV9 206 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 HSPB9Q9BQS6 159 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 OR2D2Q9H210 308 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 SDHAF2Q9NX18 166 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 ANXA10Q9UJ72 324 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 WASHC3Q9Y3C0 194 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 PSMB11A5LHX3 300 aa16.52■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 M0R1X1 148 aa16.52■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 NBR2O15453 112 aa16.52■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 NDUFA3O95167 84 aa16.52■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 SOX6P35712 828 aa16.52■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 GPR141Q7Z602 305 aa16.52■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 ZNF329Q86UD4 541 aa16.52■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 HOGA1Q86XE5 327 aa16.52■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 FOXRED2Q8IWF2 684 aa16.52■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 STPG2Q8N412 459 aa16.52■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 GVQW1Q8N7I0 195 aa16.52■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 KCNAB3O43448 404 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 OR4X2Q8NGF9 303 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 COMMD3Q9UBI1 195 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 H7C2Y5 167 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 AP4M1O00189 453 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 RBBP9O75884 186 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 RORCP51449 518 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 C5orf64Q2M2E5 130 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 BEST4Q8NFU0 473 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 RNF5Q99942 180 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 OR2W1Q9Y3N9 320 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 VWFP04275 2813 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 HLA-DRB1P01911 266 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 HLA-DQB1P01920 261 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 OPN1MWP04001 364 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 IGKV1-16P04430 117 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 OPN1MW2P0DN77 364 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 OPN1MW3P0DN78 364 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 TAS2R20P59543 309 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 TMEM69Q5SWH9 247 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 ACOT12Q8WYK0 555 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 CMTM3Q96MX0 182 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 KIAA1456Q9P272 454 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PRX2 142 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 J3QRK9 145 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 RRHO14718 337 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 TUSC2O75896 110 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 IGF1P05019 195 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 CBX5P45973 191 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 LIN54Q6MZP7 749 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 PDPNQ86YL7 162 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 FBXL15Q9H469 300 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 APOA1P02647 267 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 APOA2P02652 100 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 FCER2P06734 321 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 IGKV1-13P0DP09 117 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 LUMP51884 338 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 ARPC4P59998 168 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 RPS16P62249 146 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 SLC35B1P78383 322 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 PSG5Q15238 335 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 SNAPC3Q92966 411 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 R3HDM4Q96D70 268 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 OR51J1Q9H342 316 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 SLC35D1Q9NTN3 355 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-211ENST00000480301 ZNF580Q9UK33 172 aa16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms