RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	AIRE	O43918	545 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	CT45A6	P0DMU7	189 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	CT45A5	P0DMU8	189 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	CT45A7	P0DMV0	189 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	TG	P01266	2768 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	OR5H14	A6NHG9	310 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	ITGB1BP1	O14713	200 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	SCGN	O76038	276 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	APOA2	P02652	100 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	MC5R	P33032	325 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	TGFBR1	P36897	503 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	RAB25	P57735	213 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	LIN54	Q6MZP7	749 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	TEX38	Q6PEX7	206 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	CLCC1	Q96S66	551 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	GHITM	Q9H3K2	345 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	FBXL15	Q9H469	300 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880		H0YJW9	148 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	TFAP2A	P05549	437 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	LINC00205	P59089	165 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	ECSCR	Q19T08	205 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	HACD4	Q5VWC8	232 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	COMMD1	Q8N668	190 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	ETV7	Q9Y603	341 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	ATP6V0E1	O15342	81 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	FCER2	P06734	321 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	DTYMK	P23919	212 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	PITPNA	Q00169	270 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	CBX3	Q13185	183 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM65	Q6PI78	240 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	DIABLO	Q9NR28	239 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	RRH	O14718	337 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSR4-208	ENST00000471880	OR5H8	P0DN80	308 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSR4-208	ENST00000471880	IGLL1	P15814	213 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSR4-208	ENST00000471880	ARPC4	P59998	168 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSR4-208	ENST00000471880	YIPF6	Q96EC8	236 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSR4-208	ENST00000471880	DUX3	Q96PT4	197 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSR4-208	ENST00000471880	OR51J1	Q9H342	316 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSR4-208	ENST00000471880	ZFP57	Q9NU63	452 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSR4-208	ENST00000471880	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSR4-208	ENST00000471880	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SSR4-208	ENST00000471880	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSR4-208	ENST00000471880		G3V318	75 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSR4-208	ENST00000471880	RBBP9	O75884	186 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSR4-208	ENST00000471880	HLA-DRB1	P01911	266 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSR4-208	ENST00000471880	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SSR4-208	ENST00000471880	GNB1	P62873	340 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSR4-208	ENST00000471880	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF695	Q8IW36	515 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF383	Q8NA42	475 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SSR4-208	ENST00000471880	NPB	Q8NG41	125 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSR4-208	ENST00000471880	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SSR4-208	ENST00000471880	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSR4-208	ENST00000471880	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1W2PN81	502 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSR4-208	ENST00000471880	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSR4-208	ENST00000471880	SLC25A17	O43808	307 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSR4-208	ENST00000471880	IGKV1-16	P04430	117 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSR4-208	ENST00000471880	CHRNA7	P36544	502 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSR4-208	ENST00000471880	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SSR4-208	ENST00000471880	SCAND1	P57086	179 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSR4-208	ENST00000471880	FOXE3	Q13461	319 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSR4-208	ENST00000471880	RTL8B	Q17RB0	113 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSR4-208	ENST00000471880	DEFB136	Q30KP8	78 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSR4-208	ENST00000471880	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSR4-208	ENST00000471880	PDPN	Q86YL7	162 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSR4-208	ENST00000471880	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSR4-208	ENST00000471880	BVES	Q8NE79	360 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSR4-208	ENST00000471880	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSR4-208	ENST00000471880	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	11.62	□□□□□ -0.55
SSR4-208	ENST00000471880	SPATA2	Q9UM82	520 aa		11.62	□□□□□ -0.55

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