RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053252.8

Ctxn1-201, Transcript of Cortexin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctxn1, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Smok4aA0JLX3 433 aa18.24■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm21560D3Z7A4 205 aa18.24■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 NlkO54949 527 aa18.24■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fgf12P61329 243 aa18.24■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Btg1P62325 171 aa18.24■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tpsab1Q02844 273 aa18.24■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Psg17Q62056 475 aa18.24■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Kbtbd11Q8BNW9 633 aa18.24■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 TigarQ8BZA9 269 aa18.24■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lgi3Q8K406 548 aa18.24■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr1038Q8VGS1 319 aa18.24■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Spata25Q9DA57 226 aa18.24■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Acox1Q9R0H0 661 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 EdarQ9R187 448 aa18.24■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 D17h6s53eQ9Z1R4 293 aa18.24■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 AI182371A2AS37 356 aa18.23■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr1511E9PWU0 318 aa18.23■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr287E9PZS7 322 aa18.23■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr1510E9PZZ6 318 aa18.23■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm2174F6ZVF2 133 aa18.23■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm21833J3QPK1 500 aa18.23■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm3696K7N751 203 aa18.23■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm8281L7N235 204 aa18.23■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mrpl23O35972 146 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Hist1h1cP15864 212 aa18.23■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 SnrpbP27048 231 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tmem165P52875 323 aa18.23■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Scn1bP97952 218 aa18.23■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Scand1Q2M4I6 142 aa18.23■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 YrdcQ3U5F4 280 aa18.23■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lrrc52Q5M8M9 314 aa18.23■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 SprQ64105 261 aa18.23■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ankrd34cQ8BLB8 534 aa18.23■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 CebpzosQ8BTE5 80 aa18.23■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Wdfy2Q8BUB4 400 aa18.23■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Dhrs7cQ8CHS7 311 aa18.23■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slc25a46Q9CQS4 418 aa18.23■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ap3s1Q9DCR2 193 aa18.23■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gpx2Q9JHC0 190 aa18.23■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Egr4Q9WUF2 478 aa18.23■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ighv14-3A0A075B5R9 117 aa18.22■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cdc20bD3Z3I0 519 aa18.22■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nxpe5E0CX47 564 aa18.22■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Vmn1r173E9Q8V7 313 aa18.22■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr1471F6QVZ8 314 aa18.22■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sstr5O08858 362 aa18.22■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rab22aP35285 194 aa18.22■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Spatc1Q148B6 480 aa18.22■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tmem69Q3KQJ0 245 aa18.22■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nob1Q8BW10 403 aa18.22■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 TskuQ8CBR6 354 aa18.22■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 TdhQ8K3F7 373 aa18.22■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ccdc115Q8VE99 180 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Snu13Q9D0T1 128 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr945Q9EQB5 319 aa18.22■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zdhhc16Q9ESG8 361 aa18.22■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rbfox1Q9JJ43 396 aa18.22■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pmaip1Q9JM54 103 aa18.22■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm26992S4R1A3 76 aa18.22■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Igsf10Q3V1M1 2594 aa18.22■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr455A0A0B4J1M2 317 aa18.21■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm11127A7VMS2 374 aa18.21■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 BC035044E0CXF8 138 aa18.21■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm3250E9Q1M3 230 aa18.21■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr1348F6VB59 318 aa18.21■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Plscr5J3QM92 274 aa18.21■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr1121L7MTT1 314 aa18.21■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Htr2bQ02152 479 aa18.21■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ccl7Q03366 97 aa18.21■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sqstm1Q64337 442 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Hide1Q75VT8 222 aa18.21■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zfp729bQ80VN4 1045 aa18.21■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Prdx6bQ8BG37 224 aa18.21■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Psg16Q8K0U8 395 aa18.21■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cacul1Q8R0X2 377 aa18.21■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 TbccQ8VCN9 341 aa18.21■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr54Q8VFE6 313 aa18.21■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Osr2Q91ZD1 312 aa18.21■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Errfi1Q99JZ7 461 aa18.21■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 PsenenQ9CQR7 101 aa18.21■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lamp5Q9D387 280 aa18.21■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Hebp2Q9WU63 205 aa18.21■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Unc119Q9Z2R6 240 aa18.21■□□□□ 0.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Abca1P41233 2261 aa18.2■□□□□ 0.5
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm42372A0A1B0GT27 204 aa18.2■□□□□ 0.5
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 A0A1Y7VLU2 103 aa18.2■□□□□ 0.5
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 RnlsA7RDN6 342 aa18.2■□□□□ 0.5
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm4950D3YUM8 205 aa18.2■□□□□ 0.5
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm5239D3YYZ2 122 aa18.2■□□□□ 0.5
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rab33bO35963 229 aa18.2■□□□□ 0.5
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 SellP18337 372 aa18.2■□□□□ 0.5
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Muc13P19467 573 aa18.2■□□□□ 0.5
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Wnt2P21552 360 aa18.2■□□□□ 0.5
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rab6aP35279 208 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tmub2Q3V209 319 aa18.2■□□□□ 0.5
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slc38a8Q5HZH7 432 aa18.2■□□□□ 0.5
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 AgaQ64191 346 aa18.2■□□□□ 0.5
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sh3bgrl2Q8BG73 107 aa18.2■□□□□ 0.5
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm4922Q8C0N0 497 aa18.2■□□□□ 0.5
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nedd4lQ8CFI0 1004 aa18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 32.3 ms