Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ap3s1Q9DCR2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ap3s1Q9DCR2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ap3s1Q9DCR2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ap3s1Q9DCR2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Ap3s1Q9DCR2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Ap3s1Q9DCR2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ap3s1Q9DCR2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ap3s1Q9DCR2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ap3s1Q9DCR2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ap3s1Q9DCR2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ap3s1Q9DCR2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ap3s1Q9DCR2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ap3s1Q9DCR2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ap3s1Q9DCR2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ap3s1Q9DCR2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ap3s1Q9DCR2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ap3s1Q9DCR2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ap3s1Q9DCR2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ap3s1Q9DCR2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ap3s1Q9DCR2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ap3s1Q9DCR2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ap3s1Q9DCR2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ap3s1Q9DCR2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ap3s1Q9DCR2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ap3s1Q9DCR2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Ap3s1Q9DCR2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Ap3s1Q9DCR2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ap3s1Q9DCR2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ap3s1Q9DCR2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ap3s1Q9DCR2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ap3s1Q9DCR2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ap3s1Q9DCR2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ap3s1Q9DCR2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ap3s1Q9DCR2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ap3s1Q9DCR2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ap3s1Q9DCR2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ap3s1Q9DCR2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ap3s1Q9DCR2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ap3s1Q9DCR2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ap3s1Q9DCR2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ap3s1Q9DCR2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ap3s1Q9DCR2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ap3s1Q9DCR2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ap3s1Q9DCR2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ap3s1Q9DCR2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ap3s1Q9DCR2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ap3s1Q9DCR2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ap3s1Q9DCR2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ap3s1Q9DCR2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ap3s1Q9DCR2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ap3s1Q9DCR2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ap3s1Q9DCR2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ap3s1Q9DCR2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ap3s1Q9DCR2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ap3s1Q9DCR2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ap3s1Q9DCR2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ap3s1Q9DCR2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ap3s1Q9DCR2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ap3s1Q9DCR2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ap3s1Q9DCR2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ap3s1Q9DCR2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ap3s1Q9DCR2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ap3s1Q9DCR2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ap3s1Q9DCR2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ap3s1Q9DCR2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ap3s1Q9DCR2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ap3s1Q9DCR2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ap3s1Q9DCR2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ap3s1Q9DCR2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ap3s1Q9DCR2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ap3s1Q9DCR2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ap3s1Q9DCR2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ap3s1Q9DCR2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ap3s1Q9DCR2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ap3s1Q9DCR2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ap3s1Q9DCR2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ap3s1Q9DCR2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ap3s1Q9DCR2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ap3s1Q9DCR2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ap3s1Q9DCR2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ap3s1Q9DCR2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ap3s1Q9DCR2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ap3s1Q9DCR2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ap3s1Q9DCR2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ap3s1Q9DCR2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ap3s1Q9DCR2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ap3s1Q9DCR2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ap3s1Q9DCR2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ap3s1Q9DCR2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ap3s1Q9DCR2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ap3s1Q9DCR2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ap3s1Q9DCR2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ap3s1Q9DCR2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ap3s1Q9DCR2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ap3s1Q9DCR2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ap3s1Q9DCR2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ap3s1Q9DCR2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ap3s1Q9DCR2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ap3s1Q9DCR2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms