Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Spatc1Q148B6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Spatc1Q148B6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Spatc1Q148B6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Spatc1Q148B6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Spatc1Q148B6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Spatc1Q148B6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Spatc1Q148B6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Spatc1Q148B6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Spatc1Q148B6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Spatc1Q148B6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Spatc1Q148B6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Spatc1Q148B6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Spatc1Q148B6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Spatc1Q148B6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Spatc1Q148B6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Spatc1Q148B6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Spatc1Q148B6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Spatc1Q148B6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Spatc1Q148B6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Spatc1Q148B6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Spatc1Q148B6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Spatc1Q148B6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Spatc1Q148B6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Spatc1Q148B6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Spatc1Q148B6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Spatc1Q148B6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Spatc1Q148B6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Spatc1Q148B6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Spatc1Q148B6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Spatc1Q148B6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Spatc1Q148B6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Spatc1Q148B6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Spatc1Q148B6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Spatc1Q148B6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Spatc1Q148B6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Spatc1Q148B6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Spatc1Q148B6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Spatc1Q148B6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Spatc1Q148B6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spatc1Q148B6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spatc1Q148B6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Spatc1Q148B6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Spatc1Q148B6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Spatc1Q148B6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Spatc1Q148B6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Spatc1Q148B6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Spatc1Q148B6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Spatc1Q148B6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Spatc1Q148B6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Spatc1Q148B6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Spatc1Q148B6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Spatc1Q148B6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Spatc1Q148B6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Spatc1Q148B6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Spatc1Q148B6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spatc1Q148B6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Spatc1Q148B6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Spatc1Q148B6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Spatc1Q148B6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spatc1Q148B6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spatc1Q148B6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spatc1Q148B6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spatc1Q148B6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Spatc1Q148B6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spatc1Q148B6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Spatc1Q148B6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spatc1Q148B6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spatc1Q148B6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Spatc1Q148B6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Spatc1Q148B6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spatc1Q148B6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spatc1Q148B6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spatc1Q148B6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Spatc1Q148B6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Spatc1Q148B6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Spatc1Q148B6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Spatc1Q148B6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Spatc1Q148B6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Spatc1Q148B6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Spatc1Q148B6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Spatc1Q148B6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Spatc1Q148B6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Spatc1Q148B6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spatc1Q148B6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Spatc1Q148B6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spatc1Q148B6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spatc1Q148B6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Spatc1Q148B6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Spatc1Q148B6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Spatc1Q148B6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Spatc1Q148B6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Spatc1Q148B6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Spatc1Q148B6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spatc1Q148B6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spatc1Q148B6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spatc1Q148B6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spatc1Q148B6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spatc1Q148B6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spatc1Q148B6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
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