RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563857.1

RNPS1-208, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, human

TSL 2

Gene RNPS1, Length 739 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNPS1-208	ENST00000563857	IGKV1D-33	P01593	117 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	IGKV1-33	P01594	117 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	CD24	P25063	80 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	TALDO1	P37837	337 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	UBALD1	Q8TB05	177 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	ANK2	Q01484	3957 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	TRDC	B7Z8K6	153 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	RAB29	O14966	203 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	KCNAB3	O43448	404 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	CD36	P16671	472 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	TMEM50B	P56557	158 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	HLA-DRB3	P79483	266 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	PITPNA	Q00169	270 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	NEDD8	Q15843	81 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	12.82	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857		Q9N2K0	584 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857		A0A0A6YYD4	124 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	MC5R	P33032	325 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	OR10A3	P58181	314 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	KRTAP10-3	P60369	221 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	SLC35B1	P78383	322 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	ARFRP1	Q13795	201 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	UTF1	Q5T230	341 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	COMMD1	Q8N668	190 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	OR4F4	Q96R69	305 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	KCNK15	Q9H427	330 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	REG1B	P48304	166 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	ZNF134	P52741	427 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	HNF4G	Q14541	408 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	ZNF221	Q9UK13	617 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	ETV7	Q9Y603	341 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857		A0A0A6YYH2	397 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	SHISA3	A0PJX4	238 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857		A6NJ64	397 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	CEACAM6	P40199	344 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	OR51E2	Q9H255	320 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	12.79	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	RAB27B	O00194	218 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	SLC31A2	O15432	143 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	RBBP9	O75884	186 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	CTXN2	P0C2S0	81 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	DTYMK	P23919	212 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	SDC2	P34741	201 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	LSAMP	Q13449	338 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	GNMT	Q14749	295 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857		Q6ZS49	121 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857		Q8N6K4	173 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	RNF5	Q99942	180 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-208	ENST00000563857	PSMB11	A5LHX3	300 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RNPS1-208	ENST00000563857	OR5H14	A6NHG9	310 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RNPS1-208	ENST00000563857	AP4M1	O00189	453 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RNPS1-208	ENST00000563857	MFNG	O00587	321 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RNPS1-208	ENST00000563857	FABP7	O15540	132 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RNPS1-208	ENST00000563857	AIRE	O43918	545 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RNPS1-208	ENST00000563857	IGHG2	P01859	326 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RNPS1-208	ENST00000563857	AMY1A	P04745	511 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RNPS1-208	ENST00000563857	AMY2A	P04746	511 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RNPS1-208	ENST00000563857	OR5H8	P0DN80	308 aa		12.77	□□□□□ -0.37

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