RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485792.1

CUX1-208, Transcript of cut like homeobox 1, human

TSL 5

Gene CUX1, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF702P	Q9H963	129 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	BEX1	Q9HBH7	125 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	ING3	Q9NXR8	418 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	STUB1	Q9UNE7	303 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	COL7A1	Q02388	2944 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792		A0A1W2PPE3	182 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	MFNG	O00587	321 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	SOCS1	O15524	211 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	PROP1	O75360	226 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	MPIG6B	O95866	241 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	PAH	P00439	452 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	HBZ	P02008	142 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	RAB3B	P20337	219 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	CD24	P25063	80 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	CEACAM3	P40198	252 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	RANBP1	P43487	201 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	SCAND1	P57086	179 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	HERPUD1	Q15011	391 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	P2RY14	Q15391	338 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	C6orf183	Q5T699	404 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	C22orf42	Q6IC83	251 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	TMEM219	Q86XT9	240 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	OR8H3	Q8N146	312 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	DTX3	Q8N9I9	347 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	RFESD	Q8TAC1	157 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	FAM46B	Q96A09	425 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	YIPF6	Q96EC8	236 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	RAB18	Q9NP72	206 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	ETAA1	Q9NY74	926 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF580	Q9UK33	172 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	RAB22A	Q9UL26	194 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792		A0A087WXM4	84 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	UBE2QL1	A1L167	161 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	PDCD5	O14737	125 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	FGF16	O43320	207 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	LANCL1	O43813	399 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	OR2F2	O95006	317 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	TNFAIP8	O95379	198 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	TSPAN15	O95858	294 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	CD1B	P29016	333 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	GLP1R	P43220	463 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	RAB7A	P51149	207 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	BLCAP	P62952	87 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	MADCAM1	Q13477	382 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	RAB11B	Q15907	218 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	LY6E	Q16553	131 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	C3orf56	Q8N813	242 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	OR4K15	Q8NH41	348 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	OR1L1	Q8NH94	360 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	ARL11	Q969Q4	196 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	PECR	Q9BY49	303 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	OR51E2	Q9H255	320 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	GHITM	Q9H3K2	345 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792		Q9N2K0	584 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	RAB9B	Q9NP90	201 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	JPT1	Q9UK76	154 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	GAB2	Q9UQC2	676 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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