RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ewsr1Q61545 655 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Alkal2Q80UG6 151 aa18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Upk3bQ80YF6 275 aa18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Edem2Q8BJT9 577 aa18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc17a5Q8BN82 495 aa18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 LaynQ8C351 381 aa18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc38a2Q8CFE6 504 aa18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cmc2Q8K199 79 aa18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Calhm2Q8VEC4 323 aa18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fgf16Q9ESL8 207 aa18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nat8Q9JIY7 227 aa18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 SrpxQ9R0M3 464 aa18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 NgfrQ9Z0W1 417 aa18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bod1lE9Q6J5 3032 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm21497A0A087WRK3 222 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm17655A0A1B0GT13 591 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr432E9Q8M2 312 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1564K7N6V7 318 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hoxb5P09079 269 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bcl2l2P70345 193 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zpld1Q8BGZ8 415 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr401Q8VFX6 315 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Memo1Q91VH6 297 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dnajb11Q99KV1 358 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Arrdc2Q9D668 407 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 RbmxQ9WV02 391 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tcf20Q9EPQ8 1987 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tet1Q3URK3 2007 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 VcanQ62059 3357 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tbx15O70306 602 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ifna9P09235 190 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sult2a2P50236 285 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 HgsnatQ3UDW8 656 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc25a26Q5U680 274 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PcolceQ61398 468 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Plekhm1Q7TSI1 1074 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Plcxd3Q8BLJ3 321 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pla2g3Q8BZT7 504 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn1r178Q8R2B6 304 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dusp18Q8VE01 188 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lhx6Q9R1R0 363 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 SpdefQ9WTP3 325 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Stpg3A2RSX4 306 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Casp16-psI6L890 176 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm2035J3QP87 144 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cd40lgP27548 260 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gabrr1P56475 480 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 UbdP63072 162 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mob3aQ8BSU7 217 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 TbceQ8CIV8 524 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Uqcr10Q8R1I1 64 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc6a8Q8VBW1 640 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rbm39Q8VH51 530 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Alkbh4Q9D8F1 300 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lhx2Q9Z0S2 406 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1157A2AVC4 312 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mpig6bD7PDD4 242 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1410E9PYK6 323 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bcl6bO88282 474 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sdc1P18828 311 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cln5Q3UMW8 341 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lefty1Q64280 368 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sat2Q6P8J2 170 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr524Q7TRU0 318 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 RhofQ8BYP3 211 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rbm48Q8K2X2 371 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nfam1Q8R4V1 264 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1270Q8VGP3 304 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mrps24Q9CQV5 167 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Wbp2nlQ9D529 359 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CutcQ9D8X1 272 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 DhdhQ9DBB8 333 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tbl1xQ9QXE7 527 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 St6galnac5Q9QYJ1 336 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dcaf10A2AKB9 566 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn2r82G3UWA2 865 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr905L7N1X5 310 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm3633L7N233 213 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm9611L7N476 213 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 GrprP21729 384 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nkain2Q4PNJ2 208 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trav5d-4Q5R1F6 114 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Adamts4Q8BNJ2 833 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mbnl3Q8R003 342 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1450Q8VF19 325 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 DnlzQ9D113 177 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr957Q9EQB7 311 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Syt6Q9R0N8 511 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gabrg1Q9R0Y8 465 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm7233E9PZI8 198 aa18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm9732F6QVC4 198 aa18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn1r121K7N6J4 314 aa18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm8104K7N744 198 aa18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kcnk3O35111 409 aa18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 P01658 132 aa18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lyz2P08905 148 aa18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 InmtP40936 264 aa18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Anxa7Q07076 463 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kat7Q5SVQ0 613 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Q8VE95 218 aa18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 52.8 ms