Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0N8

Syt6, Synaptotagmin-6, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt6Q9R0N8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Syt6Q9R0N8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Syt6Q9R0N8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Syt6Q9R0N8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Syt6Q9R0N8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Syt6Q9R0N8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Syt6Q9R0N8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Syt6Q9R0N8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Syt6Q9R0N8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Syt6Q9R0N8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Syt6Q9R0N8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Syt6Q9R0N8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Syt6Q9R0N8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Syt6Q9R0N8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Syt6Q9R0N8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Syt6Q9R0N8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Syt6Q9R0N8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Syt6Q9R0N8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Syt6Q9R0N8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Syt6Q9R0N8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Syt6Q9R0N8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Syt6Q9R0N8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Syt6Q9R0N8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Syt6Q9R0N8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Syt6Q9R0N8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Syt6Q9R0N8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Syt6Q9R0N8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Syt6Q9R0N8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Syt6Q9R0N8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Syt6Q9R0N8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syt6Q9R0N8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Syt6Q9R0N8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syt6Q9R0N8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Syt6Q9R0N8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Syt6Q9R0N8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Syt6Q9R0N8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Syt6Q9R0N8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Syt6Q9R0N8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Syt6Q9R0N8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Syt6Q9R0N8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Syt6Q9R0N8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Syt6Q9R0N8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Syt6Q9R0N8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Syt6Q9R0N8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Syt6Q9R0N8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Syt6Q9R0N8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Syt6Q9R0N8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Syt6Q9R0N8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Syt6Q9R0N8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Syt6Q9R0N8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Syt6Q9R0N8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Syt6Q9R0N8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syt6Q9R0N8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Syt6Q9R0N8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Syt6Q9R0N8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Syt6Q9R0N8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syt6Q9R0N8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Syt6Q9R0N8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syt6Q9R0N8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syt6Q9R0N8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Syt6Q9R0N8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syt6Q9R0N8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syt6Q9R0N8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Syt6Q9R0N8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Syt6Q9R0N8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Syt6Q9R0N8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Syt6Q9R0N8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Syt6Q9R0N8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syt6Q9R0N8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syt6Q9R0N8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syt6Q9R0N8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syt6Q9R0N8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syt6Q9R0N8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syt6Q9R0N8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syt6Q9R0N8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Syt6Q9R0N8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Syt6Q9R0N8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syt6Q9R0N8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syt6Q9R0N8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syt6Q9R0N8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Syt6Q9R0N8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Syt6Q9R0N8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Syt6Q9R0N8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Syt6Q9R0N8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syt6Q9R0N8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syt6Q9R0N8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syt6Q9R0N8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Syt6Q9R0N8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Syt6Q9R0N8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Syt6Q9R0N8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syt6Q9R0N8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syt6Q9R0N8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syt6Q9R0N8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syt6Q9R0N8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syt6Q9R0N8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syt6Q9R0N8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syt6Q9R0N8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syt6Q9R0N8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syt6Q9R0N8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syt6Q9R0N8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms