Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSI1

Plekhm1, Pleckstrin homology domain-containing family M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plekhm1Q7TSI1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Plekhm1Q7TSI1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Plekhm1Q7TSI1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Plekhm1Q7TSI1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Plekhm1Q7TSI1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Plekhm1Q7TSI1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Plekhm1Q7TSI1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Plekhm1Q7TSI1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Plekhm1Q7TSI1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Plekhm1Q7TSI1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Plekhm1Q7TSI1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Plekhm1Q7TSI1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Plekhm1Q7TSI1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Plekhm1Q7TSI1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Plekhm1Q7TSI1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Plekhm1Q7TSI1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Plekhm1Q7TSI1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Plekhm1Q7TSI1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Plekhm1Q7TSI1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Plekhm1Q7TSI1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Plekhm1Q7TSI1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Plekhm1Q7TSI1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Plekhm1Q7TSI1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Plekhm1Q7TSI1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Plekhm1Q7TSI1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Plekhm1Q7TSI1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Plekhm1Q7TSI1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Plekhm1Q7TSI1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Plekhm1Q7TSI1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Plekhm1Q7TSI1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Plekhm1Q7TSI1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Plekhm1Q7TSI1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Plekhm1Q7TSI1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Plekhm1Q7TSI1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Plekhm1Q7TSI1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Plekhm1Q7TSI1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Plekhm1Q7TSI1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Plekhm1Q7TSI1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Plekhm1Q7TSI1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Plekhm1Q7TSI1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Plekhm1Q7TSI1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Plekhm1Q7TSI1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Plekhm1Q7TSI1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Plekhm1Q7TSI1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Plekhm1Q7TSI1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Plekhm1Q7TSI1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Plekhm1Q7TSI1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Plekhm1Q7TSI1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Plekhm1Q7TSI1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Plekhm1Q7TSI1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Plekhm1Q7TSI1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Plekhm1Q7TSI1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Plekhm1Q7TSI1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Plekhm1Q7TSI1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Plekhm1Q7TSI1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Plekhm1Q7TSI1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Plekhm1Q7TSI1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Plekhm1Q7TSI1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Plekhm1Q7TSI1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Plekhm1Q7TSI1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Plekhm1Q7TSI1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Plekhm1Q7TSI1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Plekhm1Q7TSI1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Plekhm1Q7TSI1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Plekhm1Q7TSI1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Plekhm1Q7TSI1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Plekhm1Q7TSI1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Plekhm1Q7TSI1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Plekhm1Q7TSI1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Plekhm1Q7TSI1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Plekhm1Q7TSI1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Plekhm1Q7TSI1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Plekhm1Q7TSI1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Plekhm1Q7TSI1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Plekhm1Q7TSI1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Plekhm1Q7TSI1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Plekhm1Q7TSI1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Plekhm1Q7TSI1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Plekhm1Q7TSI1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Plekhm1Q7TSI1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Plekhm1Q7TSI1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Plekhm1Q7TSI1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Plekhm1Q7TSI1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Plekhm1Q7TSI1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Plekhm1Q7TSI1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Plekhm1Q7TSI1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Plekhm1Q7TSI1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Plekhm1Q7TSI1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Plekhm1Q7TSI1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Plekhm1Q7TSI1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Plekhm1Q7TSI1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Plekhm1Q7TSI1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Plekhm1Q7TSI1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Plekhm1Q7TSI1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Plekhm1Q7TSI1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Plekhm1Q7TSI1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Plekhm1Q7TSI1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Plekhm1Q7TSI1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Plekhm1Q7TSI1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Plekhm1Q7TSI1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms