Protein–RNA interactions for Protein: Q80YF6

Upk3b, Uroplakin-3b, mousemouse

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3bQ80YF6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Upk3bQ80YF6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29,12■■■□□ 2,25
Upk3bQ80YF6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Upk3bQ80YF6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Upk3bQ80YF6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27,26■■□□□ 1,95
Upk3bQ80YF6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Upk3bQ80YF6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Upk3bQ80YF6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Upk3bQ80YF6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Upk3bQ80YF6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Upk3bQ80YF6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Upk3bQ80YF6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26,27■■□□□ 1,8
Upk3bQ80YF6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Upk3bQ80YF6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Upk3bQ80YF6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Upk3bQ80YF6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Upk3bQ80YF6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26,02■■□□□ 1,76
Upk3bQ80YF6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25,78■■□□□ 1,72
Upk3bQ80YF6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Upk3bQ80YF6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Upk3bQ80YF6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Upk3bQ80YF6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Upk3bQ80YF6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Upk3bQ80YF6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Upk3bQ80YF6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Upk3bQ80YF6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25,24■■□□□ 1,63
Upk3bQ80YF6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Upk3bQ80YF6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Upk3bQ80YF6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Upk3bQ80YF6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Upk3bQ80YF6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Upk3bQ80YF6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25,14■■□□□ 1,61
Upk3bQ80YF6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Upk3bQ80YF6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25,06■■□□□ 1,6
Upk3bQ80YF6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24,95■■□□□ 1,58
Upk3bQ80YF6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Upk3bQ80YF6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Upk3bQ80YF6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24,85■■□□□ 1,57
Upk3bQ80YF6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24,82■■□□□ 1,56
Upk3bQ80YF6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24,74■■□□□ 1,55
Upk3bQ80YF6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Upk3bQ80YF6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Upk3bQ80YF6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Upk3bQ80YF6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Upk3bQ80YF6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24,48■■□□□ 1,51
Upk3bQ80YF6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Upk3bQ80YF6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24,38■■□□□ 1,49
Upk3bQ80YF6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Upk3bQ80YF6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
Upk3bQ80YF6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24,27■■□□□ 1,48
Upk3bQ80YF6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Upk3bQ80YF6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
Upk3bQ80YF6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
Upk3bQ80YF6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
Upk3bQ80YF6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
Upk3bQ80YF6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,13■■□□□ 1,45
Upk3bQ80YF6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24,12■■□□□ 1,45
Upk3bQ80YF6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Upk3bQ80YF6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24,08■■□□□ 1,45
Upk3bQ80YF6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
Upk3bQ80YF6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24,08■■□□□ 1,44
Upk3bQ80YF6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
Upk3bQ80YF6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Upk3bQ80YF6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Upk3bQ80YF6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Upk3bQ80YF6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
Upk3bQ80YF6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
Upk3bQ80YF6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,41
Upk3bQ80YF6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,84■■□□□ 1,41
Upk3bQ80YF6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Upk3bQ80YF6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Upk3bQ80YF6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Upk3bQ80YF6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23,75■■□□□ 1,39
Upk3bQ80YF6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Upk3bQ80YF6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23,67■■□□□ 1,38
Upk3bQ80YF6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,65■■□□□ 1,38
Upk3bQ80YF6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,37
Upk3bQ80YF6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
Upk3bQ80YF6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,36
Upk3bQ80YF6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Upk3bQ80YF6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Upk3bQ80YF6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Upk3bQ80YF6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Upk3bQ80YF6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Upk3bQ80YF6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,46■■□□□ 1,35
Upk3bQ80YF6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Upk3bQ80YF6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23,36■■□□□ 1,33
Upk3bQ80YF6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Upk3bQ80YF6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
Upk3bQ80YF6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Upk3bQ80YF6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Upk3bQ80YF6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Upk3bQ80YF6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Upk3bQ80YF6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Upk3bQ80YF6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Upk3bQ80YF6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,24■■□□□ 1,31
Upk3bQ80YF6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Upk3bQ80YF6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23,21■■□□□ 1,31
Upk3bQ80YF6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Upk3bQ80YF6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23,15■■□□□ 1,3
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