Protein–RNA interactions for Protein: Q80YF6

Upk3b, Uroplakin-3b, mousemouse

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3bQ80YF6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Upk3bQ80YF6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Upk3bQ80YF6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Upk3bQ80YF6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Upk3bQ80YF6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Upk3bQ80YF6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Upk3bQ80YF6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Upk3bQ80YF6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Upk3bQ80YF6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Upk3bQ80YF6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Upk3bQ80YF6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Upk3bQ80YF6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Upk3bQ80YF6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Upk3bQ80YF6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Upk3bQ80YF6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Upk3bQ80YF6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Upk3bQ80YF6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Upk3bQ80YF6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Upk3bQ80YF6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Upk3bQ80YF6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Upk3bQ80YF6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Upk3bQ80YF6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Upk3bQ80YF6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Upk3bQ80YF6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Upk3bQ80YF6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Upk3bQ80YF6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Upk3bQ80YF6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Upk3bQ80YF6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Upk3bQ80YF6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Upk3bQ80YF6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Upk3bQ80YF6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Upk3bQ80YF6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Upk3bQ80YF6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Upk3bQ80YF6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Upk3bQ80YF6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Upk3bQ80YF6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Upk3bQ80YF6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Upk3bQ80YF6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Upk3bQ80YF6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Upk3bQ80YF6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Upk3bQ80YF6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Upk3bQ80YF6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Upk3bQ80YF6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Upk3bQ80YF6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Upk3bQ80YF6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Upk3bQ80YF6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Upk3bQ80YF6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Upk3bQ80YF6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Upk3bQ80YF6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Upk3bQ80YF6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Upk3bQ80YF6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Upk3bQ80YF6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Upk3bQ80YF6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Upk3bQ80YF6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Upk3bQ80YF6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Upk3bQ80YF6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Upk3bQ80YF6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Upk3bQ80YF6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Upk3bQ80YF6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Upk3bQ80YF6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Upk3bQ80YF6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Upk3bQ80YF6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Upk3bQ80YF6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Upk3bQ80YF6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Upk3bQ80YF6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Upk3bQ80YF6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Upk3bQ80YF6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Upk3bQ80YF6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Upk3bQ80YF6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Upk3bQ80YF6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Upk3bQ80YF6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Upk3bQ80YF6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Upk3bQ80YF6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Upk3bQ80YF6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Upk3bQ80YF6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Upk3bQ80YF6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Upk3bQ80YF6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Upk3bQ80YF6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Upk3bQ80YF6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Upk3bQ80YF6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Upk3bQ80YF6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Upk3bQ80YF6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Upk3bQ80YF6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Upk3bQ80YF6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Upk3bQ80YF6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Upk3bQ80YF6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Upk3bQ80YF6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Upk3bQ80YF6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Upk3bQ80YF6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Upk3bQ80YF6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Upk3bQ80YF6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Upk3bQ80YF6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Upk3bQ80YF6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Upk3bQ80YF6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Upk3bQ80YF6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Upk3bQ80YF6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Upk3bQ80YF6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Upk3bQ80YF6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Upk3bQ80YF6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Upk3bQ80YF6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
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