RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 P01796 113 aa9.13□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 P01797 113 aa9.13□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 P01799 113 aa9.13□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 P01800 113 aa9.13□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 P01801 115 aa9.13□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 P01802 115 aa9.13□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp13P10754 512 aa9.13□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hspb1P14602 209 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cpa3P15089 417 aa9.13□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 GdnfP48540 211 aa9.13□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fitm2P59266 262 aa9.13□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lrrc30Q3UV48 300 aa9.13□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Klra2Q60660 288 aa9.13□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp157Q6PCM4 567 aa9.13□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1211Q7TR09 311 aa9.13□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mgat4aQ812G0 535 aa9.13□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp189Q8BKP2 608 aa9.13□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Orai1Q8BWG9 304 aa9.13□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Peli1Q8C669 418 aa9.13□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Timm21Q8CCM6 249 aa9.13□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam174bQ8K064 153 aa9.13□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rdh10Q8VCH7 341 aa9.13□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr836Q8VFJ3 317 aa9.13□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1487Q8VFQ6 315 aa9.13□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Asb15Q8VHS6 583 aa9.13□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pex16Q91XC9 336 aa9.13□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Haus8Q99L00 373 aa9.13□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Teddm3Q9CQH1 294 aa9.13□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Txndc17Q9CQM5 123 aa9.13□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gar1Q9CY66 231 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Aph1cQ9DCZ9 258 aa9.13□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 BvesQ9ES83 358 aa9.13□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Isg20Q9JL16 300 aa9.13□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr122W4VSP0 330 aa9.13□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm44501A8R0T9 150 aa9.12□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr655E9Q252 308 aa9.12□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fbxw28E9Q8A4 466 aa9.12□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm21863J3KMP8 111 aa9.12□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mpzl2O70255 215 aa9.12□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Scd2P13011 358 aa9.12□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PpibP24369 216 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 BgnP28653 369 aa9.12□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Stmn2P55821 179 aa9.12□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Klhl8P59280 629 aa9.12□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Acta2P62737 377 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Actg2P63268 376 aa9.12□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lgals3bpQ07797 577 aa9.12□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 UevldQ3U1V6 471 aa9.12□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prdx2Q61171 198 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc25a23Q6GQS1 467 aa9.12□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gpr176Q80WT4 515 aa9.12□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lysmd4Q8CC84 293 aa9.12□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Micu2Q8CD10 432 aa9.12□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1110Q8VG38 312 aa9.12□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr713Q920G5 324 aa9.12□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Glyr1Q922P9 546 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Il24Q925S4 181 aa9.12□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CutalQ9D1U5 156 aa9.12□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Plekhj1Q9D240 164 aa9.12□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trappc6bQ9D289 158 aa9.12□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ube2v2Q9D2M8 145 aa9.12□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Wbp2nlQ9D529 359 aa9.12□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ndufb8Q9D6J5 186 aa9.12□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cir1Q9DA19 450 aa9.12□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lime1Q9EQR5 269 aa9.12□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ighv5-12A0A075B5Q4 117 aa9.11□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ighv3-1A0A075B5S6 116 aa9.11□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ighv1-20A0A0A6YX66 117 aa9.11□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 4930433I11RikA0A0U1RPT6 723 aa9.11□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 4930435E12RikA6X8Z9 381 aa9.11□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm3618D3Z4P5 127 aa9.11□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nxpe5E0CX47 564 aa9.11□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 C2cd6E9Q152 557 aa9.11□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr610E9Q598 315 aa9.11□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 H2-M11F6U8V3 335 aa9.11□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr936J3KMV2 267 aa9.11□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Chst3O88199 472 aa9.11□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 P01727 129 aa9.11□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cd74P04441 279 aa9.11□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 P10404 641 aa9.11□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tpsb2P21845 276 aa9.11□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Stfa1P35175 97 aa9.11□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PlaurP35456 327 aa9.11□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Clec12bQ149M0 275 aa9.11□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Flrt1Q6RKD8 674 aa9.11□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mtch1Q791T5 389 aa9.11□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cpa1Q7TPZ8 419 aa9.11□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc22a20Q80UJ1 556 aa9.11□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp955aQ80XR7 545 aa9.11□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mbnl3Q8R003 342 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SccpdhQ8R127 429 aa9.11□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r19Q8R2C7 308 aa9.11□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr63Q8VBW9 316 aa9.11□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr156Q8VGA9 318 aa9.11□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rab40bQ8VHP8 278 aa9.11□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Defb7Q91V70 71 aa9.11□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sfxn5Q925N0 342 aa9.11□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q9CR55 154 aa9.11□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zbtb8aQ9CWH1 434 aa9.11□□□□□ -0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ube2fQ9CY34 185 aa9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 54.8 ms