Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCZ9

Aph1c, Putative gamma-secretase subunit APH-1C, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1cQ9DCZ9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Aph1cQ9DCZ9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Aph1cQ9DCZ9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Aph1cQ9DCZ9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Aph1cQ9DCZ9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Aph1cQ9DCZ9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Aph1cQ9DCZ9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Aph1cQ9DCZ9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Aph1cQ9DCZ9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Aph1cQ9DCZ9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Aph1cQ9DCZ9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Aph1cQ9DCZ9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Aph1cQ9DCZ9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Aph1cQ9DCZ9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Aph1cQ9DCZ9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Aph1cQ9DCZ9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Aph1cQ9DCZ9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Aph1cQ9DCZ9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Aph1cQ9DCZ9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Aph1cQ9DCZ9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Aph1cQ9DCZ9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Aph1cQ9DCZ9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Aph1cQ9DCZ9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Aph1cQ9DCZ9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Aph1cQ9DCZ9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Aph1cQ9DCZ9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Aph1cQ9DCZ9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Aph1cQ9DCZ9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Aph1cQ9DCZ9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Aph1cQ9DCZ9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Aph1cQ9DCZ9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Aph1cQ9DCZ9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Aph1cQ9DCZ9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Aph1cQ9DCZ9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Aph1cQ9DCZ9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Aph1cQ9DCZ9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Aph1cQ9DCZ9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Aph1cQ9DCZ9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Aph1cQ9DCZ9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
Aph1cQ9DCZ9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Aph1cQ9DCZ9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Aph1cQ9DCZ9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Aph1cQ9DCZ9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Aph1cQ9DCZ9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Aph1cQ9DCZ9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Aph1cQ9DCZ9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Aph1cQ9DCZ9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Aph1cQ9DCZ9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Aph1cQ9DCZ9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Aph1cQ9DCZ9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Aph1cQ9DCZ9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Aph1cQ9DCZ9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Aph1cQ9DCZ9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Aph1cQ9DCZ9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Aph1cQ9DCZ9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Aph1cQ9DCZ9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Aph1cQ9DCZ9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Aph1cQ9DCZ9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Aph1cQ9DCZ9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Aph1cQ9DCZ9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Aph1cQ9DCZ9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Aph1cQ9DCZ9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Aph1cQ9DCZ9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Aph1cQ9DCZ9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Aph1cQ9DCZ9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Aph1cQ9DCZ9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Aph1cQ9DCZ9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Aph1cQ9DCZ9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Aph1cQ9DCZ9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Aph1cQ9DCZ9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Aph1cQ9DCZ9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Aph1cQ9DCZ9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Aph1cQ9DCZ9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Aph1cQ9DCZ9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Aph1cQ9DCZ9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Aph1cQ9DCZ9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Aph1cQ9DCZ9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Aph1cQ9DCZ9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Aph1cQ9DCZ9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Aph1cQ9DCZ9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Aph1cQ9DCZ9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Aph1cQ9DCZ9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Aph1cQ9DCZ9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Aph1cQ9DCZ9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Aph1cQ9DCZ9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Aph1cQ9DCZ9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Aph1cQ9DCZ9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Aph1cQ9DCZ9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Aph1cQ9DCZ9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Aph1cQ9DCZ9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Aph1cQ9DCZ9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Aph1cQ9DCZ9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Aph1cQ9DCZ9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Aph1cQ9DCZ9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Aph1cQ9DCZ9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Aph1cQ9DCZ9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Aph1cQ9DCZ9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Aph1cQ9DCZ9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Aph1cQ9DCZ9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Aph1cQ9DCZ9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms