Protein–RNA interactions for Protein: Q925N0

Sfxn5, Sideroflexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn5Q925N0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Sfxn5Q925N0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Sfxn5Q925N0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sfxn5Q925N0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sfxn5Q925N0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Sfxn5Q925N0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sfxn5Q925N0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sfxn5Q925N0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sfxn5Q925N0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sfxn5Q925N0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Sfxn5Q925N0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sfxn5Q925N0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sfxn5Q925N0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sfxn5Q925N0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sfxn5Q925N0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Sfxn5Q925N0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sfxn5Q925N0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Sfxn5Q925N0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sfxn5Q925N0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sfxn5Q925N0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sfxn5Q925N0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sfxn5Q925N0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sfxn5Q925N0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sfxn5Q925N0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Sfxn5Q925N0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sfxn5Q925N0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sfxn5Q925N0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sfxn5Q925N0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Sfxn5Q925N0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sfxn5Q925N0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sfxn5Q925N0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sfxn5Q925N0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sfxn5Q925N0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sfxn5Q925N0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sfxn5Q925N0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sfxn5Q925N0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sfxn5Q925N0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sfxn5Q925N0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sfxn5Q925N0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sfxn5Q925N0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Sfxn5Q925N0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sfxn5Q925N0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Sfxn5Q925N0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sfxn5Q925N0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sfxn5Q925N0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sfxn5Q925N0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sfxn5Q925N0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sfxn5Q925N0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sfxn5Q925N0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sfxn5Q925N0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Sfxn5Q925N0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sfxn5Q925N0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sfxn5Q925N0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sfxn5Q925N0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sfxn5Q925N0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sfxn5Q925N0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sfxn5Q925N0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sfxn5Q925N0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Sfxn5Q925N0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Sfxn5Q925N0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sfxn5Q925N0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sfxn5Q925N0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sfxn5Q925N0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Sfxn5Q925N0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sfxn5Q925N0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sfxn5Q925N0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sfxn5Q925N0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sfxn5Q925N0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sfxn5Q925N0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sfxn5Q925N0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sfxn5Q925N0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sfxn5Q925N0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sfxn5Q925N0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sfxn5Q925N0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sfxn5Q925N0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sfxn5Q925N0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sfxn5Q925N0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sfxn5Q925N0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sfxn5Q925N0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sfxn5Q925N0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sfxn5Q925N0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sfxn5Q925N0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sfxn5Q925N0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sfxn5Q925N0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sfxn5Q925N0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sfxn5Q925N0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sfxn5Q925N0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Sfxn5Q925N0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sfxn5Q925N0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sfxn5Q925N0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sfxn5Q925N0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sfxn5Q925N0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sfxn5Q925N0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sfxn5Q925N0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sfxn5Q925N0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sfxn5Q925N0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sfxn5Q925N0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sfxn5Q925N0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sfxn5Q925N0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sfxn5Q925N0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms