Protein–RNA interactions for Protein: P59280

Klhl8, Kelch-like protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl8P59280 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Klhl8P59280 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Klhl8P59280 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Klhl8P59280 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Klhl8P59280 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Klhl8P59280 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Klhl8P59280 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Klhl8P59280 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Klhl8P59280 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Klhl8P59280 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Klhl8P59280 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Klhl8P59280 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Klhl8P59280 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Klhl8P59280 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Klhl8P59280 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Klhl8P59280 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Klhl8P59280 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Klhl8P59280 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Klhl8P59280 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Klhl8P59280 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Klhl8P59280 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Klhl8P59280 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Klhl8P59280 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Klhl8P59280 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Klhl8P59280 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Klhl8P59280 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Klhl8P59280 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Klhl8P59280 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Klhl8P59280 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Klhl8P59280 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Klhl8P59280 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Klhl8P59280 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Klhl8P59280 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Klhl8P59280 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Klhl8P59280 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Klhl8P59280 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhl8P59280 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Klhl8P59280 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klhl8P59280 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klhl8P59280 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Klhl8P59280 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Klhl8P59280 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klhl8P59280 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klhl8P59280 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klhl8P59280 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Klhl8P59280 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klhl8P59280 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Klhl8P59280 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Klhl8P59280 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Klhl8P59280 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klhl8P59280 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klhl8P59280 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klhl8P59280 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Klhl8P59280 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klhl8P59280 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klhl8P59280 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Klhl8P59280 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Klhl8P59280 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Klhl8P59280 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Klhl8P59280 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Klhl8P59280 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Klhl8P59280 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Klhl8P59280 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Klhl8P59280 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Klhl8P59280 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Klhl8P59280 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Klhl8P59280 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Klhl8P59280 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Klhl8P59280 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klhl8P59280 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Klhl8P59280 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Klhl8P59280 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klhl8P59280 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Klhl8P59280 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Klhl8P59280 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klhl8P59280 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klhl8P59280 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klhl8P59280 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klhl8P59280 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Klhl8P59280 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl8P59280 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl8P59280 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl8P59280 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klhl8P59280 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl8P59280 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl8P59280 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Klhl8P59280 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl8P59280 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klhl8P59280 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klhl8P59280 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Klhl8P59280 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhl8P59280 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhl8P59280 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhl8P59280 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Klhl8P59280 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhl8P59280 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl8P59280 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl8P59280 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klhl8P59280 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klhl8P59280 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms