Protein–RNA interactions for Protein: Q07797

Lgals3bp, Galectin-3-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgals3bpQ07797 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Lgals3bpQ07797 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Lgals3bpQ07797 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lgals3bpQ07797 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lgals3bpQ07797 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lgals3bpQ07797 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lgals3bpQ07797 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lgals3bpQ07797 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Lgals3bpQ07797 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lgals3bpQ07797 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Lgals3bpQ07797 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lgals3bpQ07797 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lgals3bpQ07797 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Lgals3bpQ07797 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lgals3bpQ07797 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Lgals3bpQ07797 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lgals3bpQ07797 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lgals3bpQ07797 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lgals3bpQ07797 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lgals3bpQ07797 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Lgals3bpQ07797 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lgals3bpQ07797 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lgals3bpQ07797 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lgals3bpQ07797 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lgals3bpQ07797 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lgals3bpQ07797 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lgals3bpQ07797 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Lgals3bpQ07797 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lgals3bpQ07797 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lgals3bpQ07797 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lgals3bpQ07797 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lgals3bpQ07797 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lgals3bpQ07797 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lgals3bpQ07797 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Lgals3bpQ07797 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lgals3bpQ07797 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lgals3bpQ07797 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lgals3bpQ07797 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lgals3bpQ07797 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lgals3bpQ07797 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lgals3bpQ07797 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lgals3bpQ07797 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lgals3bpQ07797 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lgals3bpQ07797 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lgals3bpQ07797 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lgals3bpQ07797 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Lgals3bpQ07797 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Lgals3bpQ07797 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lgals3bpQ07797 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lgals3bpQ07797 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lgals3bpQ07797 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lgals3bpQ07797 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lgals3bpQ07797 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lgals3bpQ07797 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lgals3bpQ07797 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lgals3bpQ07797 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lgals3bpQ07797 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lgals3bpQ07797 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lgals3bpQ07797 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lgals3bpQ07797 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lgals3bpQ07797 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Lgals3bpQ07797 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lgals3bpQ07797 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Lgals3bpQ07797 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lgals3bpQ07797 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lgals3bpQ07797 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lgals3bpQ07797 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lgals3bpQ07797 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lgals3bpQ07797 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lgals3bpQ07797 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lgals3bpQ07797 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lgals3bpQ07797 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lgals3bpQ07797 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lgals3bpQ07797 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lgals3bpQ07797 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lgals3bpQ07797 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lgals3bpQ07797 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lgals3bpQ07797 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lgals3bpQ07797 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lgals3bpQ07797 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lgals3bpQ07797 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lgals3bpQ07797 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lgals3bpQ07797 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lgals3bpQ07797 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Lgals3bpQ07797 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lgals3bpQ07797 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lgals3bpQ07797 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lgals3bpQ07797 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Lgals3bpQ07797 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lgals3bpQ07797 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lgals3bpQ07797 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lgals3bpQ07797 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lgals3bpQ07797 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lgals3bpQ07797 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lgals3bpQ07797 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lgals3bpQ07797 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lgals3bpQ07797 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lgals3bpQ07797 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lgals3bpQ07797 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lgals3bpQ07797 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms