Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWH1

Zbtb8a, Zinc finger and BTB domain-containing protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb8aQ9CWH1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,29■■■□□ 2,6
Zbtb8aQ9CWH1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30,71■■■□□ 2,51
Zbtb8aQ9CWH1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,16■■■□□ 2,42
Zbtb8aQ9CWH1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Zbtb8aQ9CWH1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,35■■■□□ 2,29
Zbtb8aQ9CWH1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Zbtb8aQ9CWH1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Zbtb8aQ9CWH1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Zbtb8aQ9CWH1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Zbtb8aQ9CWH1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Zbtb8aQ9CWH1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Zbtb8aQ9CWH1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Zbtb8aQ9CWH1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Zbtb8aQ9CWH1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Zbtb8aQ9CWH1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27,72■■■□□ 2,03
Zbtb8aQ9CWH1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27,69■■■□□ 2,02
Zbtb8aQ9CWH1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Zbtb8aQ9CWH1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Zbtb8aQ9CWH1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Zbtb8aQ9CWH1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Zbtb8aQ9CWH1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Zbtb8aQ9CWH1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27,29■■□□□ 1,96
Zbtb8aQ9CWH1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Zbtb8aQ9CWH1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,17■■□□□ 1,94
Zbtb8aQ9CWH1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Zbtb8aQ9CWH1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Zbtb8aQ9CWH1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Zbtb8aQ9CWH1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Zbtb8aQ9CWH1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26,85■■□□□ 1,89
Zbtb8aQ9CWH1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Zbtb8aQ9CWH1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Zbtb8aQ9CWH1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26,76■■□□□ 1,87
Zbtb8aQ9CWH1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Zbtb8aQ9CWH1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26,72■■□□□ 1,87
Zbtb8aQ9CWH1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Zbtb8aQ9CWH1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Zbtb8aQ9CWH1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26,45■■□□□ 1,82
Zbtb8aQ9CWH1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Zbtb8aQ9CWH1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Zbtb8aQ9CWH1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Zbtb8aQ9CWH1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
Zbtb8aQ9CWH1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,39■■□□□ 1,81
Zbtb8aQ9CWH1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Zbtb8aQ9CWH1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26,25■■□□□ 1,79
Zbtb8aQ9CWH1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26,24■■□□□ 1,79
Zbtb8aQ9CWH1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,2■■□□□ 1,78
Zbtb8aQ9CWH1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Zbtb8aQ9CWH1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Zbtb8aQ9CWH1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Zbtb8aQ9CWH1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Zbtb8aQ9CWH1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Zbtb8aQ9CWH1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,93■■□□□ 1,74
Zbtb8aQ9CWH1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Zbtb8aQ9CWH1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Zbtb8aQ9CWH1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Zbtb8aQ9CWH1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Zbtb8aQ9CWH1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Zbtb8aQ9CWH1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Zbtb8aQ9CWH1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25,74■■□□□ 1,71
Zbtb8aQ9CWH1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Zbtb8aQ9CWH1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Zbtb8aQ9CWH1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,67■■□□□ 1,7
Zbtb8aQ9CWH1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Zbtb8aQ9CWH1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25,65■■□□□ 1,7
Zbtb8aQ9CWH1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Zbtb8aQ9CWH1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Zbtb8aQ9CWH1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Zbtb8aQ9CWH1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Zbtb8aQ9CWH1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Zbtb8aQ9CWH1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25,47■■□□□ 1,67
Zbtb8aQ9CWH1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Zbtb8aQ9CWH1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Zbtb8aQ9CWH1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Zbtb8aQ9CWH1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Zbtb8aQ9CWH1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Zbtb8aQ9CWH1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Zbtb8aQ9CWH1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Zbtb8aQ9CWH1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,21■■□□□ 1,63
Zbtb8aQ9CWH1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,63
Zbtb8aQ9CWH1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25,2■■□□□ 1,62
Zbtb8aQ9CWH1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Zbtb8aQ9CWH1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Zbtb8aQ9CWH1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Zbtb8aQ9CWH1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Zbtb8aQ9CWH1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25,04■■□□□ 1,6
Zbtb8aQ9CWH1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Zbtb8aQ9CWH1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Zbtb8aQ9CWH1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24,96■■□□□ 1,59
Zbtb8aQ9CWH1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Zbtb8aQ9CWH1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Zbtb8aQ9CWH1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Zbtb8aQ9CWH1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Zbtb8aQ9CWH1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24,85■■□□□ 1,57
Zbtb8aQ9CWH1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Zbtb8aQ9CWH1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Zbtb8aQ9CWH1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Zbtb8aQ9CWH1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Zbtb8aQ9CWH1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Zbtb8aQ9CWH1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Zbtb8aQ9CWH1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24,72■■□□□ 1,55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,7 ms