RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450875.5

CITED1-208, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, human

TSL 2

Gene CITED1, Length 505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CITED1-208	ENST00000450875	HKR1	P10072	659 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	RAB6A	P20340	208 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	PAX6	P26367	422 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	CD34	P28906	385 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	BRS3	P32247	399 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	GDNF	P39905	211 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	MNDA	P41218	407 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	LY6E	Q16553	131 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	AANAT	Q16613	207 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	IDNK	Q5T6J7	187 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	UBALD1	Q8TB05	177 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	LEAP2	Q969E1	77 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	RPE	Q96AT9	228 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	RAB3C	Q96E17	227 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	CENPO	Q9BU64	300 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	MMP28	Q9H239	520 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	RNF167	Q9H6Y7	350 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	RAB18	Q9NP72	206 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	DPM3	Q9P2X0	92 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	GNG12	Q9UBI6	72 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	HSF4	Q9ULV5	492 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	JMJD1C	Q15652	2540 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875		A0A075B6Q4	140 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875		A0A087X0M5	115 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875		A0A0A6YYD4	124 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875		A0A0B4J203	849 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875		A0A1B0GX30	115 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	C12orf77	C9JDV5	145 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	C15orf65	H3BRN8	121 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875		J3QR06	171 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	GPR137B	O60478	399 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	SCGN	O76038	276 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	RGS11	O94810	467 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	HBZ	P02008	142 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	LPL	P06858	475 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	CD3G	P09693	182 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	IL3RA	P26951	378 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	CFP	P27918	469 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	TALDO1	P37837	337 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	RAB13	P51153	203 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	MADCAM1	Q13477	382 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	ARFRP1	Q13795	201 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	ARL6IP1	Q15041	203 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	C3orf56	Q8N813	242 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	OR4F5	Q8NH21	305 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	OR1L1	Q8NH94	360 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	TOMM40L	Q969M1	308 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	PTX4	Q96A99	478 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	GALM	Q96C23	342 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	YIPF6	Q96EC8	236 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	PECR	Q9BY49	303 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	AK3	Q9UIJ7	227 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	PSG11	Q9UQ72	335 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875		A0A1W2PPE3	182 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	VGLL3	A8MV65	326 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	OOSP1	A8MZH6	123 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	LDLRAD4	O15165	306 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	TMEM127	O75204	238 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	IGLV1-47	P01700	117 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	GNB3	P16520	340 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	EFNB2	P52799	333 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	RAG2	P55895	527 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	TMEM50B	P56557	158 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CITED1-208	ENST00000450875	PLA2G7	Q13093	441 aa		6.55	□□□□□ -1.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.5 ms