RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384540.1

RNU6-601P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 601, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-601P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-601P-201ENST00000384540 GNRH2O43555 120 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 GATCO43716 136 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 LY6HO94772 140 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 NPPAP01160 153 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 LTAP01374 205 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 HSPA13P48723 471 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 RCN1Q15293 331 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 TMEM155Q4W5P6 130 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 HSP90B2PQ58FF3 399 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 PLCXD3Q63HM9 321 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 CCDC148Q8NFR7 591 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 OR11H1Q8NG94 326 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 OR51Q1Q8NH59 317 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 ASB17Q8WXJ9 295 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 UPK3BQ9BT76 320 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 FAAP24Q9BTP7 215 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 CHST5Q9GZS9 411 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 NRBP2Q9NSY0 501 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 NMRK1Q9NWW6 199 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 BRWD1Q9NSI6 2320 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 CENPXA8MT69 81 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 C9J4A7 227 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 CSKP41240 450 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 RHOAP61586 193 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC35A2P78381 396 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 LCN2P80188 198 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC36A2Q495M3 483 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC35D2Q76EJ3 337 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 LHFPL1Q86WI0 220 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 CA13Q8N1Q1 262 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 OR5J2Q8NH18 312 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 SMR3AQ99954 134 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 MIEN1Q9BRT3 115 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 RAB20Q9NX57 234 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 DSCAML1Q8TD84 2053 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 KCPQ6ZWJ8 1503 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 GRIFINA4D1Z8 144 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 PRH1P02810 166 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 RPSAP08865 295 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 OR8G3PP0DMU2 310 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC2A1P11166 492 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 CTSEP14091 401 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 IVDP26440 423 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 DEFA6Q01524 100 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 GBE1Q04446 702 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 BSPH1Q075Z2 132 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 ATP6V1FQ16864 119 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 DUPD1Q68J44 220 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 RASL11AQ6T310 242 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 DYNAPQ8N1N2 210 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 GPATCH11Q8N954 259 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 CLHC1Q8NHS4 586 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 MBD3L1Q8WWY6 194 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 NELFBQ8WX92 580 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 BIRC8Q96P09 236 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 VAT1Q99536 393 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 HAUS4Q9H6D7 363 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 LZTFL1Q9NQ48 299 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 SNX12Q9UMY4 172 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 FIS1Q9Y3D6 152 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 ALG5Q9Y673 324 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 NAV3Q8IVL0 2385 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 WDR90Q96KV7 1748 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 LOC100653049A0A140TA62 436 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 B4DEV8 164 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 SEC14L6B5MCN3 397 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 J3QLI3 93 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF737O75373 536 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZMPSTE24O75844 475 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 KRT34O76011 436 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 LIPCP11150 499 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 PYCR1P32322 319 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 GCLMP48507 274 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 PDK2Q15119 407 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 HES3Q5TGS1 186 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 FAM19A2Q8N3H0 131 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 ATPAF2Q8N5M1 289 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF439Q8NDP4 499 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 TBX5Q99593 518 aa-0.09□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms