RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475195.5

ATG4B-216, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 762 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF773Q6PK81 442 aa13.3□□□□□ -0.28
ATG4B-216ENST00000475195 C3orf56Q8N813 242 aa13.3□□□□□ -0.28
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF596Q8TC21 504 aa13.3□□□□□ -0.28
ATG4B-216ENST00000475195 MRGPRDQ8TDS7 321 aa13.3□□□□□ -0.28
ATG4B-216ENST00000475195 C16orf95Q9H693 158 aa13.3□□□□□ -0.28
ATG4B-216ENST00000475195 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa13.3□□□□□ -0.28
ATG4B-216ENST00000475195 DPM3Q9P2X0 92 aa13.3□□□□□ -0.28
ATG4B-216ENST00000475195 FBLN5Q9UBX5 448 aa13.3□□□□□ -0.28
ATG4B-216ENST00000475195 LY6LH3BQJ8 138 aa13.29□□□□□ -0.28
ATG4B-216ENST00000475195 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa13.29□□□□□ -0.28
ATG4B-216ENST00000475195 PDCD6O75340 191 aa13.29□□□□□ -0.28
ATG4B-216ENST00000475195 MDKP21741 143 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
ATG4B-216ENST00000475195 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
ATG4B-216ENST00000475195 RANBP1P43487 201 aa13.29□□□□□ -0.28
ATG4B-216ENST00000475195 PRRX1P54821 245 aa13.29□□□□□ -0.28
ATG4B-216ENST00000475195 RAG2P55895 527 aa13.29□□□□□ -0.28
ATG4B-216ENST00000475195 KCTD21Q4G0X4 260 aa13.29□□□□□ -0.28
ATG4B-216ENST00000475195 UTF1Q5T230 341 aa13.29□□□□□ -0.28
ATG4B-216ENST00000475195 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
ATG4B-216ENST00000475195 OR10K2Q6IF99 312 aa13.29□□□□□ -0.28
ATG4B-216ENST00000475195 LIAT1Q6ZQX7 453 aa13.29□□□□□ -0.28
ATG4B-216ENST00000475195 FAM89BQ8N5H3 189 aa13.29□□□□□ -0.28
ATG4B-216ENST00000475195 OR52M1Q8NGK5 317 aa13.29□□□□□ -0.28
ATG4B-216ENST00000475195 OR9G1Q8NH87 305 aa13.29□□□□□ -0.28
ATG4B-216ENST00000475195 BEX1Q9HBH7 125 aa13.29□□□□□ -0.28
ATG4B-216ENST00000475195 V9GY05 133 aa13.29□□□□□ -0.28
ATG4B-216ENST00000475195 SHISA3A0PJX4 238 aa13.28□□□□□ -0.28
ATG4B-216ENST00000475195 CLPSL1A2RUU4 121 aa13.28□□□□□ -0.28
ATG4B-216ENST00000475195 MPIG6BO95866 241 aa13.28□□□□□ -0.28
ATG4B-216ENST00000475195 CHATP28329 748 aa13.28□□□□□ -0.28
ATG4B-216ENST00000475195 GLP1RP43220 463 aa13.28□□□□□ -0.28
ATG4B-216ENST00000475195 HLA-DRB5Q30154 266 aa13.28□□□□□ -0.28
ATG4B-216ENST00000475195 Q6ZSV7 163 aa13.28□□□□□ -0.28
ATG4B-216ENST00000475195 OR2W3Q7Z3T1 314 aa13.28□□□□□ -0.28
ATG4B-216ENST00000475195 LINC01006Q8NI28 216 aa13.28□□□□□ -0.28
ATG4B-216ENST00000475195 RFESDQ8TAC1 157 aa13.28□□□□□ -0.28
ATG4B-216ENST00000475195 FAM46BQ96A09 425 aa13.28□□□□□ -0.28
ATG4B-216ENST00000475195 CREB3L1Q96BA8 519 aa13.28□□□□□ -0.28
ATG4B-216ENST00000475195 TMEM59Q9BXS4 323 aa13.28□□□□□ -0.28
ATG4B-216ENST00000475195 LPAR5Q9H1C0 372 aa13.28□□□□□ -0.28
ATG4B-216ENST00000475195 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
ATG4B-216ENST00000475195 ETAA1Q9NY74 926 aa13.28□□□□□ -0.28
ATG4B-216ENST00000475195 FBN3Q75N90 2809 aa13.28□□□□□ -0.28
ATG4B-216ENST00000475195 TRAV39A0A0B4J263 110 aa13.27□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 LEUTXA8MZ59 168 aa13.27□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 J3QR06 171 aa13.27□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 F2RL2O00254 374 aa13.27□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 LDLRAD4O15165 306 aa13.27□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 ARSBP15848 533 aa13.27□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 SSTR5P35346 364 aa13.27□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 RAB13P51153 203 aa13.27□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 FAM189A2Q15884 450 aa13.27□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 OLFML2AQ68BL7 652 aa13.27□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 SHISA2Q6UWI4 295 aa13.27□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF554Q86TJ5 538 aa13.27□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 C8orf31Q8N9H6 132 aa13.27□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 PLGRKTQ9HBL7 147 aa13.27□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 PSG11Q9UQ72 335 aa13.27□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 TCF19Q9Y242 345 aa13.27□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 HILPDAQ9Y5L2 63 aa13.27□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 A6NDX4 124 aa13.26□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 OOSP1A8MZH6 123 aa13.26□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 AIPO00170 330 aa13.26□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 TOR1AO14656 332 aa13.26□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 PDCD5O14737 125 aa13.26□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 NFYBP25208 207 aa13.26□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 KIR2DS4P43632 304 aa13.26□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 LOXL3P58215 753 aa13.26□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 C2orf76Q3KRA6 126 aa13.26□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 Q3ZCU0 254 aa13.26□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 OR51D1Q8NGF3 324 aa13.26□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 NDNFQ8TB73 568 aa13.26□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 NEK7Q8TDX7 302 aa13.26□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 CCDC107Q8WV48 283 aa13.26□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 ARL11Q969Q4 196 aa13.26□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 CYYR1Q96J86 154 aa13.26□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 NEDD4LQ96PU5 975 aa13.26□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 NICN1Q9BSH3 213 aa13.26□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 MMP28Q9H239 520 aa13.26□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 RAB18Q9NP72 206 aa13.26□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa13.26□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 A0A0A6YYD4 124 aa13.25□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 UBE2QL1A1L167 161 aa13.25□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 FAM172BPA6NC97 362 aa13.25□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 C12orf77C9JDV5 145 aa13.25□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 PSMB9P28065 219 aa13.25□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 CEACAM3P40198 252 aa13.25□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 TMEM50BP56557 158 aa13.25□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 PROK1P58294 105 aa13.25□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 RAB11BQ15907 218 aa13.25□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 LY6EQ16553 131 aa13.25□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 TRAT1Q6PIZ9 186 aa13.25□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 LINC00311Q8N616 119 aa13.25□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 OR4K15Q8NH41 348 aa13.25□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 FAM3DQ96BQ1 224 aa13.25□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 SULT4A1Q9BR01 284 aa13.25□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.7 ms