RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561514.1

PALB2-202, Transcript of partner and localizer of BRCA2, humanhuman

TSL 5

Gene PALB2, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALB2-202ENST00000561514 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa6.85□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 OR4Q3Q8NH05 313 aa6.85□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 OR8S1Q8NH09 359 aa6.85□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 HPSE2Q8WWQ2 592 aa6.85□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 OR5P3Q8WZ94 311 aa6.85□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 GAFA1Q96PS6 74 aa6.85□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 MICU1Q9BPX6 476 aa6.85□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 ABHD6Q9BV23 337 aa6.85□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 MMP28Q9H239 520 aa6.85□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa6.85□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa6.85□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 SIRT7Q9NRC8 400 aa6.85□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 CMC2Q9NRP2 79 aa6.85□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 CENPMQ9NSP4 180 aa6.85□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 ERVK13-1Q9NX77 482 aa6.85□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 HAO2Q9NYQ3 351 aa6.85□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 ZNF319Q9P2F9 582 aa6.85□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 ONECUT1Q9UBC0 465 aa6.85□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 ZNF391Q9UJN7 358 aa6.85□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa6.85□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 MPC1Q9Y5U8 109 aa6.85□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.84□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 MEIKINA0A087WXM9 373 aa6.84□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 A0A0B4J293 547 aa6.84□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 CDIPTO14735 213 aa6.84□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 RPP14O95059 124 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 GASTP01350 101 aa6.84□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 APOC3P02656 99 aa6.84□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 MT-ND2P03891 347 aa6.84□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 NMBP08949 121 aa6.84□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 CSF1P09603 554 aa6.84□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 GABRA5P31644 462 aa6.84□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 INPP1P49441 399 aa6.84□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 PPP3R1P63098 170 aa6.84□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 KLRD1Q13241 179 aa6.84□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.84□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 SLC35E4Q6ICL7 350 aa6.84□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 C1QL4Q86Z23 238 aa6.84□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 FTMTQ8N4E7 242 aa6.84□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 ZNF561Q8N587 486 aa6.84□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 OR2T33Q8NG76 320 aa6.84□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 PPP1R35Q8TAP8 253 aa6.84□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 EDARADDQ8WWZ3 215 aa6.84□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 ORAI1Q96D31 301 aa6.84□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 SDSLQ96GA7 329 aa6.84□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 MBOAT4Q96T53 435 aa6.84□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 AMELYQ99218 206 aa6.84□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 RTL8AQ9BWD3 113 aa6.84□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 TSSK6Q9BXA6 273 aa6.84□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.84□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 WDR13Q9H1Z4 485 aa6.84□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 OR10A2Q9H208 303 aa6.84□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 SPACA1Q9HBV2 294 aa6.84□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa6.84□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 LRP12Q9Y561 859 aa6.84□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 TENM3Q9P273 2699 aa6.84□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa6.83□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 A0A1B0GV90 55 aa6.83□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 TMEM218A2RU14 115 aa6.83□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 FABP12A6NFH5 140 aa6.83□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 NKX6-3A6NJ46 265 aa6.83□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 ANXA2P2A6NMY6 339 aa6.83□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 G3V4G9 280 aa6.83□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 TNFRSF11BO00300 401 aa6.83□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 LYRM1O43325 122 aa6.83□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 PRAF2O60831 178 aa6.83□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 ATG12O94817 140 aa6.83□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 FADS2O95864 444 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 IL1AP01583 271 aa6.83□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 GYPBP06028 91 aa6.83□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 GADD45AP24522 165 aa6.83□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 HSD11B1P28845 292 aa6.83□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 SDC2P34741 201 aa6.83□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 GNALP38405 381 aa6.83□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 DLX1P56177 255 aa6.83□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 PKIAP61925 76 aa6.83□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 NHLH2Q02577 135 aa6.83□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 PRDX4Q13162 271 aa6.83□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 OPCMLQ14982 345 aa6.83□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 TAF13Q15543 124 aa6.83□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 ZNF79Q15937 498 aa6.83□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 KLHL22Q53GT1 634 aa6.83□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 FAM131AQ6UXB0 335 aa6.83□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 Q6ZPA2 131 aa6.83□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 FAM57BQ71RH2 274 aa6.83□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 Q8N2B8 174 aa6.83□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 PNKDQ8N490 385 aa6.83□□□□□ -1.32
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