RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479554.5

ATG4B-218, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 4

Gene ATG4B, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-218ENST00000479554 GDPD3Q7L5L3 318 aa11.63□□□□□ -0.55
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ATG4B-218ENST00000479554 OR8H2Q8N162 312 aa11.63□□□□□ -0.55
ATG4B-218ENST00000479554 OR13D1Q8NGV5 346 aa11.63□□□□□ -0.55
ATG4B-218ENST00000479554 OR5AK2Q8NH90 309 aa11.63□□□□□ -0.55
ATG4B-218ENST00000479554 PPP1R35Q8TAP8 253 aa11.63□□□□□ -0.55
ATG4B-218ENST00000479554 AP3S1Q92572 193 aa11.63□□□□□ -0.55
ATG4B-218ENST00000479554 THRSPQ92748 146 aa11.63□□□□□ -0.55
ATG4B-218ENST00000479554 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
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ATG4B-218ENST00000479554 FRRS1LQ9P0K9 344 aa11.63□□□□□ -0.55
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ATG4B-218ENST00000479554 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa11.62□□□□□ -0.55
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ATG4B-218ENST00000479554 C17orf98A8MV24 154 aa11.62□□□□□ -0.55
ATG4B-218ENST00000479554 ZFPL1O95159 310 aa11.62□□□□□ -0.55
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ATG4B-218ENST00000479554 ZNF728P0DKX0 622 aa11.62□□□□□ -0.55
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ATG4B-218ENST00000479554 ATP1B3P54709 279 aa11.62□□□□□ -0.55
ATG4B-218ENST00000479554 DLX6P56179 175 aa11.62□□□□□ -0.55
ATG4B-218ENST00000479554 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP11.62□□□□□ -0.55
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ATG4B-218ENST00000479554 C11orf88Q6PI97 169 aa11.62□□□□□ -0.55
ATG4B-218ENST00000479554 LIAT1Q6ZQX7 453 aa11.62□□□□□ -0.55
ATG4B-218ENST00000479554 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa11.62□□□□□ -0.55
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ATG4B-218ENST00000479554 DNAAF1Q8NEP3 725 aa11.62□□□□□ -0.55
ATG4B-218ENST00000479554 OR13C5Q8NGS8 318 aa11.62□□□□□ -0.55
ATG4B-218ENST00000479554 BORCS5Q969J3 196 aa11.62□□□□□ -0.55
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ATG4B-218ENST00000479554 SNX22Q96L94 193 aa11.62□□□□□ -0.55
ATG4B-218ENST00000479554 BARHL1Q9BZE3 327 aa11.62□□□□□ -0.55
ATG4B-218ENST00000479554 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
ATG4B-218ENST00000479554 AKIP1Q9NQ31 210 aa11.62□□□□□ -0.55
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ATG4B-218ENST00000479554 WNK1Q9H4A3 2382 aa11.61□□□□□ -0.55
ATG4B-218ENST00000479554 HAND1O96004 215 aa11.61□□□□□ -0.55
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ATG4B-218ENST00000479554 OR2T6Q8NHC8 308 aa11.61□□□□□ -0.55
ATG4B-218ENST00000479554 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
ATG4B-218ENST00000479554 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
ATG4B-218ENST00000479554 ZNF714Q96N38 554 aa11.61□□□□□ -0.55
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ATG4B-218ENST00000479554 TMEM82A0PJX8 343 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG4B-218ENST00000479554 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG4B-218ENST00000479554 ODF3BA8MYP8 253 aa11.6□□□□□ -0.55
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ATG4B-218ENST00000479554 FAM189A2Q15884 450 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG4B-218ENST00000479554 Q499Y3 187 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG4B-218ENST00000479554 HSD17B12Q53GQ0 312 aa11.6□□□□□ -0.55
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ATG4B-218ENST00000479554 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG4B-218ENST00000479554 UTS2BQ765I0 119 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG4B-218ENST00000479554 DYNAPQ8N1N2 210 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG4B-218ENST00000479554 MFSD4AQ8N468 514 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG4B-218ENST00000479554 KLHDC1Q8N7A1 406 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG4B-218ENST00000479554 DTX3Q8N9I9 347 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG4B-218ENST00000479554 PIFOQ8TCI5 191 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG4B-218ENST00000479554 GPR148Q8TDV2 347 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG4B-218ENST00000479554 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
ATG4B-218ENST00000479554 SPSB1Q96BD6 273 aa11.6□□□□□ -0.55
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